Protein–RNA interactions for Protein: P84022

SMAD3, Mothers against decapentaplegic homolog 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 425 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMAD3P84022 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 RBM45-201ENST00000286070 1785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PCGF6-201ENST00000337211 1950 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 TCTA-201ENST00000273590 2146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 SPAG16-204ENST00000413312 2258 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 CLINT1-207ENST00000523908 2346 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 SHF-201ENST00000290894 2500 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 NKX6-1-201ENST00000295886 2628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 MYH14-206ENST00000596571 5988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 GATA5-201ENST00000252997 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 KAT5-203ENST00000377046 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AIPL1-209ENST00000575265 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 TBC1D4-201ENST00000377625 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 FBLN7-205ENST00000409903 1989 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC011473.4-202ENST00000250366 1602 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC138969.1-205ENST00000381497 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 COLEC11-206ENST00000403096 1557 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 DXO-203ENST00000375356 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PC-214ENST00000628663 1470 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 TM2D3-207ENST00000559107 1353 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 SNHG11-201ENST00000359074 1031 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ZNF655-216ENST00000449244 544 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC010503.2-201ENST00000599292 296 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 WNT1-202ENST00000613114 1278 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 CBR3-AS1-216ENST00000624883 564 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 GLYCTK-202ENST00000436784 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 TYMS-203ENST00000323274 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PTN-201ENST00000348225 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 HDAC11-202ENST00000402259 1000 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 RHOQP3-201ENST00000437982 621 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 REEP2-201ENST00000254901 2099 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 YTHDC2-207ENST00000515883 2629 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ILF3-217ENST00000589998 2622 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 C2CD2-202ENST00000380486 6345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 FAM109B-201ENST00000321753 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 GPR35-201ENST00000319838 2249 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 TNFSF11-203ENST00000398795 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 GPR75-201ENST00000394705 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ZNF282-204ENST00000610704 3722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ACADS-201ENST00000242592 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 GADD45B-201ENST00000215631 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 MAFG-201ENST00000357736 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 MBD3-201ENST00000156825 5518 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 CABP5-201ENST00000293255 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 RBM43-202ENST00000409092 579 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 OARD1-208ENST00000469104 704 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 UBTF-203ENST00000393606 2683 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AL121761.2-201ENST00000598007 1648 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 SEPT6-202ENST00000354228 1576 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 INSM1-201ENST00000310227 2829 ntAPPRIS P1 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PHKA1-204ENST00000373545 6173 ntTSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PKD2-201ENST00000237596 5056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 CEP78-202ENST00000376597 2618 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ADORA2A-215ENST00000618076 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 AOC3-204ENST00000591562 2522 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
SMAD3P84022 EEF1AKMT3-204ENST00000551420 836 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.5 ms