Protein–RNA interactions for Protein: P63132

HERVK_113, Endogenous retrovirus group K member 113 Pol protein, humanhuman

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HERVK_113P63132 UBXN6-202ENST00000394765 1809 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 RBM15B-201ENST00000563281 6641 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 P2RY6-207ENST00000538328 1425 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.38
HERVK_113P63132 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 IL12RB2-202ENST00000371000 2454 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC105001.2-201ENST00000554914 1753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ATXN2-227ENST00000616825 4575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SLX1A-201ENST00000251303 1091 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SLX1B-201ENST00000330181 1165 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 MCF2L-207ENST00000397024 490 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 IFNL4-202ENST00000616270 1132 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CD24-206ENST00000620405 586 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC009154.2-201ENST00000621177 724 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 RTBDN-201ENST00000322912 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 MOB3A-201ENST00000357066 3391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.39■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LGALS8-AS1-201ENST00000487567 1457 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DBNDD2-204ENST00000372712 1537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AP001922.1-201ENST00000499390 1504 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FAM19A3-201ENST00000361886 1056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ANKRD34C-AS1-201ENST00000557790 594 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TK2-213ENST00000563369 882 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 C16orf74-203ENST00000602675 744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 GXYLT1P4-201ENST00000613576 1192 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AD000864.1-201ENST00000624076 2295 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LTBP4-203ENST00000308370 4948 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TNIP1-208ENST00000520931 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ZBED3-AS1-208ENST00000512001 1668 ntTSL 3 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 NEIL2-202ENST00000403422 2016 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KRT8-201ENST00000293308 1882 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 WNT8A-204ENST00000506684 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SYNM-202ENST00000336292 7394 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 BRPF1-203ENST00000424362 4712 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ALDH5A1-202ENST00000357578 5248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 POU4F3-201ENST00000230732 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 HLA-F-217ENST00000334668 1283 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 YPEL3-201ENST00000398838 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 HLA-F-220ENST00000434407 884 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC026471.3-201ENST00000565137 578 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ACP2-206ENST00000529444 1719 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FBXO7-201ENST00000266087 2195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ARFIP2-204ENST00000445086 1300 ntTSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TBX18-202ENST00000369663 6245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 FAM50A-202ENST00000393600 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
HERVK_113P63132 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.9 ms