Protein–RNA interactions for Protein: P56749

CLDN12, Claudin-12, humanhuman

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Length 244 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN12P56749 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 FCER2-201ENST00000346664 1596 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 FCER2-205ENST00000597921 1560 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 FBXL20-205ENST00000583610 1739 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GIT2-202ENST00000354574 5387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CKMT1A-202ENST00000413453 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 VIPR2-201ENST00000262178 3944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GPM6B-204ENST00000398361 1033 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 IGHMBP2-205ENST00000539224 785 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LMF1-201ENST00000262301 2621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DGKZ-201ENST00000318201 3213 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC35G1-202ENST00000427197 2402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 FSCN1-201ENST00000382361 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SNX16-201ENST00000345957 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC39A8-201ENST00000356736 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AL365277.1-202ENST00000331856 2241 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AK4-208ENST00000546702 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ELAVL2-208ENST00000544538 3789 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NFATC2-206ENST00000609943 5690 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 POLR3E-203ENST00000418581 2529 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MEG3-205ENST00000412736 1615 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 HIBCH-202ENST00000392332 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CDHR4-201ENST00000343366 1188 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 DUSP23-203ENST00000368109 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN12P56749 CA15P1-201ENST00000481698 905 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC103855.2-201ENST00000533315 573 ntTSL 4 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TMEM72-203ENST00000544540 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CLN6-206ENST00000565471 1075 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC027796.4-201ENST00000575741 874 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN12P56749 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ETV7-204ENST00000373738 1570 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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CLDN12P56749 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC002310.5-201ENST00000569360 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 MVK-201ENST00000228510 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 BAIAP2-205ENST00000435091 2129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 C15orf38-AP3S2-201ENST00000398333 2439 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SP7-203ENST00000537210 1472 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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CLDN12P56749 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 SLC9A7-201ENST00000328306 3838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TRA2B-203ENST00000382191 976 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 LAT2-204ENST00000398475 2453 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 AC128676.1-201ENST00000454392 318 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 HS6ST2-204ENST00000521489 2607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 KRT8P7-201ENST00000533003 1432 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 TARBP2-220ENST00000552857 916 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
CLDN12P56749 KRT18P6-201ENST00000555540 1265 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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