Protein–RNA interactions for Protein: P56545

CTBP2, C-terminal-binding protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 445 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTBP2P56545 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ELP5-204ENST00000396628 1423 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 LRRC56-201ENST00000270115 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SLC47A2-202ENST00000350657 2285 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PLXND1-205ENST00000504689 546 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 REEP1-209ENST00000541910 969 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 SYNGR4-204ENST00000601610 859 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 ZSWIM8-213ENST00000603114 5919 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 PHKA1-201ENST00000339490 6121 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 WNT9B-201ENST00000290015 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 KCNH1-214ENST00000640566 1365 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTBP2P56545 HIC1-202ENST00000399849 3156 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 NCCRP1-201ENST00000339852 1978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HCK-210ENST00000629881 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HHIPL1-201ENST00000330710 7390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 MTMR14-203ENST00000353332 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HLA-DQB1-204ENST00000399084 1734 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CDC25A-201ENST00000302506 3783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PIANP-204ENST00000540656 2432 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AANAT-202ENST00000392492 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SMYD3-204ENST00000403792 1209 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC027682.5-201ENST00000567122 530 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC140504.1-202ENST00000568222 652 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SMIM29-209ENST00000636500 1186 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 METTL5-207ENST00000410097 1370 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FCGRT-202ENST00000426395 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ANXA6-201ENST00000354546 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TBC1D4-202ENST00000377636 6364 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 NOMO1-208ENST00000620755 3921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ICA1-201ENST00000265577 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 STN1-201ENST00000224950 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RASL10B-201ENST00000603017 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TBC1D20-201ENST00000354200 4466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ARFRP1-207ENST00000612157 1698 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 KANSL2-212ENST00000550347 2714 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 SNED1-204ENST00000401884 4538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 IER3-202ENST00000376377 1350 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 HIST2H2AB-201ENST00000331128 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ISCU-202ENST00000392807 1069 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 ISCU-203ENST00000431221 799 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 FAM86EP-206ENST00000510506 987 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 H3F3B-206ENST00000587560 551 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 RIN1-201ENST00000311320 2693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTBP2P56545 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.3 ms