Protein–RNA interactions for Protein: P55769

SNU13, NHP2-like protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNU13P55769 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RGL3-202ENST00000393423 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 IRF3-203ENST00000377139 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FAM212A-201ENST00000333323 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ANK1-206ENST00000348036 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TRPT1-202ENST00000394546 1058 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC007563.2-201ENST00000447289 552 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC104596.1-202ENST00000507486 759 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TRPT1-210ENST00000541278 941 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PRTN3-202ENST00000544537 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 MTHFS-202ENST00000559722 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SMIM1-203ENST00000561886 491 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SLC12A5-201ENST00000243964 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF140-207ENST00000440550 1663 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TFAP2B-202ENST00000393655 5773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
SNU13P55769 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 WDR59-202ENST00000536050 1752 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CLDND1-204ENST00000394185 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 NDRG2-208ENST00000397851 2022 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CAMK2G-205ENST00000372765 1822 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AL360181.3-201ENST00000468317 1605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ARHGAP26-202ENST00000378004 9200 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RABL2A-202ENST00000393165 1118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CYB561D2-204ENST00000424512 1212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RNF165-206ENST00000590330 1049 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KLK7-206ENST00000597707 1054 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 IRF3-222ENST00000599144 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ST20-MTHFS-203ENST00000615374 679 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ATP6AP2-214ENST00000636287 1904 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 LINC00634-201ENST00000381348 1510 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PLD3-205ENST00000409419 1966 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ARHGAP8-202ENST00000356099 1584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GHDC-202ENST00000414034 2496 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC020661.1-201ENST00000503052 1584 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 FO681492.1-203ENST00000622861 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC093010.1-201ENST00000473625 1624 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 MMEL1-201ENST00000378412 2849 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PRSS53-201ENST00000280606 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CHTOP-203ENST00000368690 2165 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RCAN3-209ENST00000616511 2527 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 SLC10A3-202ENST00000369649 1763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 KRT18P55-202ENST00000578578 1546 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ZNF667-AS1-201ENST00000585445 1521 ntTSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PTS-201ENST00000280362 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 NDUFAF2-201ENST00000296597 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AL162457.2-201ENST00000447909 937 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 ETFA-216ENST00000560726 942 ntTSL 3 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AL157888.1-201ENST00000631930 593 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 AC092865.7-201ENST00000641832 219 ntBASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
SNU13P55769 PDE2A-226ENST00000544570 3119 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40 ms