Protein–RNA interactions for Protein: P54727

RAD23B, UV excision repair protein RAD23 homolog B, humanhuman

Predictions only

Length 409 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAD23BP54727 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 GTF2H4-201ENST00000259895 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 PCDH1-201ENST00000287008 4793 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 MOCS2-202ENST00000396954 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TRAPPC3-202ENST00000373162 1056 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 MYL6-209ENST00000548293 753 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 HLA-A-203ENST00000376809 1611 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 POFUT2-201ENST00000331343 4825 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
RAD23BP54727 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 AC009949.1-201ENST00000623048 1830 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 GPANK1-201ENST00000375893 1598 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 RAB40C-203ENST00000535977 2717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 CSAD-209ENST00000453446 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 CAPN1-201ENST00000279247 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ZNF133-210ENST00000535822 2341 ntTSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ITGA7-201ENST00000257879 4120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 EIF3C-211ENST00000566866 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 AC012317.2-201ENST00000623305 2251 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 AC092329.2-201ENST00000598402 547 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 HSPA4-205ENST00000617074 2358 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 IVNS1ABP-202ENST00000367498 4199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 WBP2-219ENST00000626827 1867 ntTSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 DAG1-219ENST00000538711 5582 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 KDM1A-201ENST00000356634 3033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 AC069368.1-202ENST00000437723 750 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ZNF436-AS1-203ENST00000454117 997 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ANKRD29-202ENST00000585908 846 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 YAP1-208ENST00000531439 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 MED29-202ENST00000594368 1471 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 KRT16P6-201ENST00000417510 1873 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 APMAP-201ENST00000217456 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ABHD14B-203ENST00000395008 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ECSIT-202ENST00000270517 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 DMKN-213ENST00000447113 1611 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 AC125634.1-201ENST00000438758 1403 ntBASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 CCNI2-201ENST00000378731 2355 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 RABL2A-204ENST00000393167 2179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 PIP5K1C-205ENST00000589578 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ZNF710-201ENST00000268154 4617 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
RAD23BP54727 PAFAH1B3-201ENST00000262890 1003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.1 ms