Protein–RNA interactions for Protein: P53609

PGGT1B, Geranylgeranyl transferase type-1 subunit beta, humanhuman

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Length 377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PGGT1BP53609 KANSL1-202ENST00000432791 5343 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CYHR1-204ENST00000438911 2020 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.67■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CLK2-202ENST00000361168 1934 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 OSBP2-202ENST00000401475 2468 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 FAM124A-202ENST00000322475 4761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ZSCAN10-202ENST00000538082 2350 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CBSL-202ENST00000617706 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RHOF-201ENST00000267205 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SNCB-202ENST00000393693 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC091133.2-201ENST00000505903 428 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC116353.4-201ENST00000507279 576 ntTSL 4 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CLDN7-204ENST00000571881 735 ntTSL 3 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 BDKRB1-201ENST00000216629 1687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 ZNF264-202ENST00000536056 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TSHZ3-201ENST00000240587 5176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AC022898.2-201ENST00000616822 1312 ntBASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CAMK2B-203ENST00000347193 1577 ntTSL 1 (best) BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.66■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 SLC39A13-213ENST00000533076 1805 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 AP003717.1-202ENST00000537019 1412 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 PHF20L1-203ENST00000337920 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CACNA1A-246ENST00000637736 8340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RASGRP2-205ENST00000377489 583 ntTSL 3 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 KRT18P65-201ENST00000439811 1286 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RN7SL850P-201ENST00000579959 291 ntBASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 GCDH-201ENST00000222214 1956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TRPM2-202ENST00000300482 5989 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 APBB1IP-201ENST00000356785 1513 ntTSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
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PGGT1BP53609 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 GGPS1-206ENST00000488594 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.65■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 TMTC4-203ENST00000376234 3483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.42
PGGT1BP53609 WAC-205ENST00000375664 5924 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 PML-205ENST00000395132 1738 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 KRT89P-201ENST00000620027 1478 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ZNF32-201ENST00000374433 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MIEN1-201ENST00000394231 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 RCN1P1-201ENST00000400413 996 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 ELAVL1-202ENST00000593807 856 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 FGF14-AS2-201ENST00000606448 1074 ntBASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 BDKRB1-204ENST00000611804 1085 ntAPPRIS P1 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 GRAP2-202ENST00000407075 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.64■□□□□ 0.41
PGGT1BP53609 MCMBP-201ENST00000360003 4169 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.41
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