Protein–RNA interactions for Protein: P50548

ERF, ETS domain-containing transcription factor ERF, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERFP50548 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERFP50548 SERPINB6-208ENST00000616722 2047 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERFP50548 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERFP50548 EPHA10-203ENST00000427468 3167 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERFP50548 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERFP50548 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERFP50548 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERFP50548 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
ERFP50548 TOM1-210ENST00000449058 2389 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERFP50548 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERFP50548 PCDHGA11-202ENST00000518882 2263 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
ERFP50548 RUFY2-203ENST00000388768 4502 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 FAM109A-203ENST00000547838 2846 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 STK35-201ENST00000381482 6685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 FSCN2-201ENST00000334850 1551 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 NAT16-204ENST00000455377 1492 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 DYDC2-202ENST00000372197 2022 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 LGALS9-202ENST00000313648 1378 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 FAM3A-203ENST00000369641 1359 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 OCIAD1-204ENST00000425583 1915 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 KRTCAP3-201ENST00000288873 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 PMF1-BGLAP-202ENST00000368276 852 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 AKAIN1-201ENST00000434239 575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 KRT18P41-201ENST00000518924 1277 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC006435.1-201ENST00000571775 1065 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 EML2-AS1-202ENST00000591087 838 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 TIMM50-213ENST00000599794 786 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 TMED3-203ENST00000536821 2265 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 NKX2-2-201ENST00000377142 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 CORO6-212ENST00000584969 1416 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 MGARP-201ENST00000398955 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC060834.1-201ENST00000443027 2032 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 SDHAP2-201ENST00000455183 2001 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 KCNJ8-201ENST00000240662 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
ERFP50548 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 GCSH-201ENST00000315467 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 UROS-202ENST00000368778 1556 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 MAN1C1-203ENST00000374332 4641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 MAN1C1-208ENST00000611903 4647 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 AMDHD2-201ENST00000293971 1459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 FAM83A-202ENST00000518448 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 KRT86-201ENST00000293525 2091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 KCNIP4-206ENST00000447367 1641 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 EXO5-202ENST00000358527 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 CDC42EP5-201ENST00000301200 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC110769.1-201ENST00000420161 815 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 LCN6-203ENST00000476567 1015 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 MFSD4A-206ENST00000489709 1136 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC026427.1-201ENST00000508993 555 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 UNC93B6-201ENST00000525262 1143 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 TESMIN-209ENST00000544963 1235 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC010646.1-201ENST00000594059 515 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 AC068987.5-201ENST00000642069 987 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 KRT8P50-201ENST00000562022 1438 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 RPS6KB1-204ENST00000443572 1913 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 KATNAL2-208ENST00000592005 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
ERFP50548 SARDH-205ENST00000422262 2367 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 SELENOF-207ENST00000611507 1785 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ERFP50548 DCAKD-208ENST00000614054 2054 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.9 ms