Protein–RNA interactions for Protein: P48995

TRPC1, Short transient receptor potential channel 1, humanhuman

Predictions only

Length 793 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRPC1P48995 LINC01381-201ENST00000431650 466 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 RNF144A-AS1-204ENST00000437589 618 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 RNF144A-AS1-205ENST00000439208 757 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 BX664615.1-201ENST00000443558 458 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC139887.4-201ENST00000607877 719 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 INPP5B-201ENST00000373021 3934 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NARF-204ENST00000390006 1766 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 DAPK2-205ENST00000558069 1473 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC009053.2-201ENST00000563701 2365 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 VAV3-210ENST00000527011 4510 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SLK-201ENST00000335753 7673 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TUFM-201ENST00000313511 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 KIRREL2-205ENST00000592409 2563 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TMEM160-201ENST00000253047 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CCK-201ENST00000334681 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 MED4-202ENST00000378586 931 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ELOVL2-AS1-202ENST00000456616 903 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SDHA-213ENST00000510361 2148 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GCHFR-202ENST00000558467 785 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ATP6V0C-203ENST00000565223 668 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC002310.4-201ENST00000568114 377 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ATP6V0C-204ENST00000568562 477 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TRAPPC6A-201ENST00000006275 805 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ADO-201ENST00000373783 3627 ntAPPRIS P1 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 EML3-212ENST00000494176 2901 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 EML3-216ENST00000529309 2909 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 UQCC3-202ENST00000531323 2288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ZNF346-208ENST00000511834 2306 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NAA60-201ENST00000360862 2522 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 STAT3-201ENST00000264657 5047 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 THOC3-212ENST00000628318 1442 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GLRX2-201ENST00000367439 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CD1E-211ENST00000368166 1271 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 HAGLR-204ENST00000425005 623 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC117947.1-201ENST00000427448 529 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC009185.1-201ENST00000517634 911 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 PP7080-201ENST00000342584 1876 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TCIRG1-201ENST00000265686 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
TRPC1P48995 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.6 ms