Protein–RNA interactions for Protein: P43307

SSR1, Translocon-associated protein subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 286 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SSR1P43307 LZTS3-203ENST00000360342 4055 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 BTBD1-202ENST00000379403 1467 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 AL109910.2-201ENST00000607733 1953 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 CCDC137-201ENST00000329214 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 HNRNPUL2-BSCL2-201ENST00000403734 4001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 C11orf58-201ENST00000228136 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
SSR1P43307 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 HHATL-201ENST00000310417 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 NSMF-204ENST00000371473 3556 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SLC22A11-202ENST00000377581 1975 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 CAB39-202ENST00000409788 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 IL18BP-207ENST00000404792 2172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 EXOC3L2-201ENST00000252482 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 RPL39L-203ENST00000455270 653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 RPL29-204ENST00000479017 670 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 MNX1-AS1-201ENST00000480284 1041 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ENDOV-202ENST00000517295 908 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 RPS20-210ENST00000523936 899 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ANP32AP1-202ENST00000560832 1074 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 AL138966.2-201ENST00000621997 464 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 MTHFD2L-203ENST00000395759 2354 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 CNST-202ENST00000366512 2422 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 RGS3-202ENST00000342620 1714 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SATB2-203ENST00000428695 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 MAP2K5-201ENST00000178640 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PDIA2-202ENST00000404312 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 FCGRT-201ENST00000221466 1798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ZIC3-202ENST00000370606 1968 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 AP001273.2-201ENST00000638767 2993 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 DKK3-201ENST00000326932 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SLCO6A1-201ENST00000379807 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SMOC1-201ENST00000361956 2040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 CISD2-201ENST00000273986 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 A4GALT-203ENST00000401850 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 COMMD1-201ENST00000311832 911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 TDRD7-201ENST00000355295 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PVRIG2P-201ENST00000435460 978 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 AC008687.5-201ENST00000593746 558 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 FMR1-AS1_2.1-201ENST00000613724 127 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 TMEM216-203ENST00000515837 1958 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 H1FNT-201ENST00000335017 1300 ntAPPRIS P1 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ST3GAL3-205ENST00000347631 1324 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 HAGHL-203ENST00000389703 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ACBD3-201ENST00000366812 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 TRIM50-201ENST00000333149 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 POLR1D-221ENST00000637180 2262 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 LINC00602-201ENST00000629776 2065 ntBASIC18.93■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSR1P43307 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSR1P43307 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSR1P43307 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
SSR1P43307 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.9 ms