Protein–RNA interactions for Protein: P43155

CRAT, Carnitine O-acetyltransferase, humanhuman

Predictions only

Length 626 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CRATP43155 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC013275.1-201ENST00000413602 2019 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 RPL26L1-205ENST00000519974 695 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 CAVIN3-203ENST00000530979 957 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 USF2-205ENST00000594064 1179 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC034238.1-212ENST00000596137 723 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC116407.2-201ENST00000613639 860 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 STXBP2-202ENST00000414284 1859 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 TLE2-219ENST00000591529 2483 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 ASIC2-201ENST00000225823 3443 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 NFATC4-231ENST00000557451 5613 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
CRATP43155 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 TBC1D10C-201ENST00000312390 1497 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 SUPT20H-203ENST00000360252 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 KRT18P22-201ENST00000402024 1347 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 OR10H2-201ENST00000305899 1041 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 SDCBP2-203ENST00000381808 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 CHCHD6-204ENST00000508789 1159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 TMA16-209ENST00000513272 803 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC015712.4-203ENST00000559673 630 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC025259.3-201ENST00000564531 542 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 SDF4-201ENST00000263741 2079 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 BRD2-201ENST00000374825 4894 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 TSC2-204ENST00000401874 5421 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 ZFC3H1-211ENST00000552037 1484 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC026954.2-202ENST00000575474 2571 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 ESAM-201ENST00000278927 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
CRATP43155 TRPC1-201ENST00000273482 4324 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 SLC39A1-211ENST00000621013 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 EIF4E1B-201ENST00000318682 1974 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 SETD3-202ENST00000331768 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 CXADR-204ENST00000400166 1080 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 HYAL3-203ENST00000415204 959 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 SMIM29-206ENST00000476320 1297 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC034232.1-201ENST00000506026 1064 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC141257.4-201ENST00000634557 245 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC136944.6-201ENST00000634818 245 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 SUSD2-201ENST00000358321 3404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 ELOVL7-205ENST00000508821 3994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 PNCK-203ENST00000370145 1455 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 AC004832.3-202ENST00000439838 1470 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 FGFR4-207ENST00000502906 2638 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 WT1-201ENST00000332351 3122 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
CRATP43155 PTPN18-201ENST00000175756 3669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 CTTN-203ENST00000376561 2247 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
CRATP43155 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.5 ms