Protein–RNA interactions for Protein: P42575

CASP2, Caspase-2, humanhuman

Predictions only

Length 452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP2P42575 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CYB561D2-201ENST00000232508 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GPR6-201ENST00000275169 1089 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AC131097.3-201ENST00000413820 1228 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 FAM104A-205ENST00000581110 512 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 PRLHR-202ENST00000636925 1275 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 RABL6-203ENST00000371663 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CNTLN-202ENST00000380647 5576 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CYP4F8-210ENST00000612078 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CACNA1G-201ENST00000352832 7848 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CLDN9-201ENST00000445369 2050 ntAPPRIS P1 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 KCNN2-208ENST00000631899 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ARNTL-205ENST00000403510 2745 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CCT7-215ENST00000539919 2031 ntTSL 2 BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 PLEKHF2-201ENST00000315367 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.54■□□□□ 0.4
CASP2P42575 SLC9A6-203ENST00000370701 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 RNF187-201ENST00000305943 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GAS7-203ENST00000432992 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 SP100-208ENST00000427101 1922 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ANKRD24-202ENST00000318934 3906 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ZNF48-206ENST00000622647 2695 ntTSL 4 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ELN-202ENST00000320399 2274 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CD14-201ENST00000302014 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 KRT13-201ENST00000246635 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 SPACA1-201ENST00000237201 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 C20orf166-AS1-202ENST00000436101 761 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 DEDD2-209ENST00000598727 1037 ntTSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 C16orf74-207ENST00000602914 761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 HECTD2-203ENST00000371681 2175 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC17.53■□□□□ 0.4
CASP2P42575 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 MID1IP1-202ENST00000378474 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 DCAF5-201ENST00000341516 5953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 SMARCD3-202ENST00000356800 1669 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 NEU1-206ENST00000375631 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 MID1IP1-201ENST00000336949 2536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 JAK3-201ENST00000458235 5432 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 THUMPD2-204ENST00000505747 1970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GFOD1-203ENST00000379287 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 GNGT2-201ENST00000300406 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ANKRD20A18P-201ENST00000359341 492 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 RASA4DP-201ENST00000460726 1199 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 FIS1-207ENST00000474120 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 CALM3-208ENST00000596362 1203 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 ACD-203ENST00000602320 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.52■□□□□ 0.4
CASP2P42575 DLK2-203ENST00000372488 1590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP2P42575 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP2P42575 TMEM128-201ENST00000254742 1737 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP2P42575 PAK4-209ENST00000599470 1715 ntTSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP2P42575 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP2P42575 SQOR-201ENST00000260324 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP2P42575 RNPS1-219ENST00000566397 1685 ntTSL 2 BASIC17.52■□□□□ 0.39
CASP2P42575 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 ERI1-203ENST00000519292 2107 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 TRA2A-211ENST00000538367 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 CBS-201ENST00000352178 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 BIRC7-202ENST00000342412 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 FKBP3-202ENST00000396062 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 NYX-201ENST00000342595 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 ADCK5-201ENST00000308860 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 MFSD2A-203ENST00000420632 1914 ntTSL 2 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 ZNF517-201ENST00000359971 2335 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 GUCA2B-201ENST00000372581 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 TSPY8-203ENST00000383005 435 ntTSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 AC005521.1-201ENST00000393351 872 ntBASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 ZDHHC4-205ENST00000396713 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.51■□□□□ 0.39
CASP2P42575 CEP78-204ENST00000415759 2623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.51■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms