Protein–RNA interactions for Protein: P37198

NUP62, Nuclear pore glycoprotein p62, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP62P37198 PPP1CA-202ENST00000358239 1054 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ZNF451-202ENST00000370702 458 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SPATA25-201ENST00000372519 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 CSF1-205ENST00000420111 1083 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 OTUB1-203ENST00000428192 1296 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AC073210.2-201ENST00000430369 194 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AC026185.1-201ENST00000445748 174 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AC093787.1-201ENST00000450396 207 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AP000785.1-201ENST00000527314 613 ntTSL 4 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AC138028.5-201ENST00000566114 558 ntTSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AC105036.2-201ENST00000569468 176 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 HEMK1-206ENST00000455834 1499 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 R3HCC1-210ENST00000625275 1489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 BEST2-202ENST00000549706 2183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 STK4-201ENST00000372801 2038 ntTSL 2 BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 KRT17P1-201ENST00000399211 1546 ntBASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.12■□□□□ 0.01
NUP62P37198 CLDN5-204ENST00000618236 1374 ntAPPRIS P1 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 STRADA-254ENST00000640999 2336 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SLA2-202ENST00000360672 2171 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ADCY1-204ENST00000621543 1647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 PAWR-201ENST00000328827 9129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ECE2-205ENST00000404464 3229 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RRAS2-203ENST00000526063 970 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RRAS2-208ENST00000532814 982 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 MAX-217ENST00000557277 728 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SNAP23-210ENST00000564153 775 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ULK4P1-204ENST00000565949 721 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 MAPK14-210ENST00000622903 1003 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 KRT13-208ENST00000587544 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AC026412.3-201ENST00000605200 1661 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 LINC00847-201ENST00000501855 1871 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 LRFN3-201ENST00000246529 2513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ART5-203ENST00000397068 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 MOK-233ENST00000524214 1539 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 UBE2E3-201ENST00000392415 1347 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 HGS-201ENST00000329138 2970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 CRELD1-201ENST00000326434 1994 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 TNKS-211ENST00000520408 1964 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SLCO4C1-201ENST00000310954 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 NCK2-205ENST00000451463 1795 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RTN1-209ENST00000611068 2647 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 CRK-204ENST00000574295 1391 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
NUP62P37198 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 GPANK1-204ENST00000375900 1814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 GOLGA6L5P-202ENST00000515341 1828 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RMDN3-202ENST00000338376 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 GATA4-201ENST00000335135 3414 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 PCMT1-201ENST00000367378 1293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 KRTAP5-8-201ENST00000398534 1183 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 DIMT1-202ENST00000506390 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ANAPC11-212ENST00000577425 603 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ATP6V0E2-211ENST00000606024 893 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 MTMR9LP-203ENST00000426597 1545 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 TSPAN3-207ENST00000559494 1326 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RCC2P6-201ENST00000526625 1557 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 AP5S1-203ENST00000379573 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 DUS1L-201ENST00000306796 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 DDHD2-205ENST00000520272 4532 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 NOP9-201ENST00000267425 6033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 LCOR-202ENST00000356016 4834 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 GTPBP1-201ENST00000216044 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ZMIZ1-205ENST00000611351 2196 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP62P37198 PDPK1-202ENST00000342085 7241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP62P37198 RPS6KB2-201ENST00000312629 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
NUP62P37198 ITGB2-AS1-202ENST00000441379 2282 ntTSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 21.4 ms