Protein–RNA interactions for Protein: P36897

TGFBR1, TGF-beta receptor type-1, humanhuman

Predictions only

Length 503 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TGFBR1P36897 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SMN1-209ENST00000514951 1308 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RTL8B-201ENST00000391440 2026 ntAPPRIS P1 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 GPBAR1-202ENST00000519574 1382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RHOBTB1-201ENST00000337910 4473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC021148.1-201ENST00000513652 1532 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 KAZN-208ENST00000636203 6874 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 VRK3-225ENST00000601912 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 JAG1-201ENST00000254958 6048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 UBR3-203ENST00000418381 7951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CDKN1A-201ENST00000244741 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MIER1-204ENST00000371012 2420 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 S100A14-203ENST00000368701 1080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RTL8A-201ENST00000370775 1244 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AL023284.2-201ENST00000405850 579 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RHEB-204ENST00000472642 900 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SMN2-202ENST00000380742 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RNF7-201ENST00000273480 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TMEM53-205ENST00000372244 1472 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 GPAT2P1-201ENST00000444924 1672 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CSNK2A2-201ENST00000262506 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RUVBL1-201ENST00000322623 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PTPRO-209ENST00000543886 2070 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MRAP-201ENST00000303645 935 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ELOA3-201ENST00000330682 1877 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 METTL23-201ENST00000341249 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FAM72C-201ENST00000369175 1658 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 LRRC26-201ENST00000371542 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AL391244.2-201ENST00000428932 543 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC004980.1-204ENST00000429707 299 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 PRKY-204ENST00000533551 1019 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ARF3-208ENST00000541959 807 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 LINC01148-201ENST00000557527 1763 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 DHRS4-206ENST00000558581 1143 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CES1P1-204ENST00000574030 877 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 ZNF561-AS1-201ENST00000585797 1593 ntTSL 2 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FFAR3-202ENST00000594310 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MYC-209ENST00000641252 345 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 KLHL21-202ENST00000377663 6445 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 GATAD2A-202ENST00000360315 5671 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 CXorf40A-208ENST00000434353 1524 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 KRT17-205ENST00000540235 1438 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 SLC38A8-201ENST00000299709 1308 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
TGFBR1P36897 UCHL5-204ENST00000367451 1346 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms