Protein–RNA interactions for Protein: P36406

TRIM23, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM23, humanhuman

Predictions only

Length 574 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM23P36406 PHF12-201ENST00000268756 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ENTPD2-202ENST00000355097 2095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MRPL10-203ENST00000414011 1622 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SLC35E1-208ENST00000595753 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 P3H1-204ENST00000397054 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 HBQ1-201ENST00000199708 536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LGALS1-201ENST00000215909 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 HBA2-201ENST00000251595 605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ATPIF1-201ENST00000335514 494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TFPT-203ENST00000391759 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC073648.2-201ENST00000510116 352 ntBASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC021739.2-201ENST00000558375 964 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 CDK2AP1-207ENST00000618072 1144 ntTSL 3 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 KLHDC3-201ENST00000244670 1903 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PEX16-201ENST00000241041 1479 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GABRB1-201ENST00000295454 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC090206.1-201ENST00000615734 1678 ntTSL 5 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ATRIP-203ENST00000357105 2403 ntTSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MMD2-202ENST00000404774 2415 ntTSL 1 (best) BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.48■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NFATC1-217ENST00000591814 4819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RCAN3-205ENST00000436717 2574 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PMAIP1-202ENST00000316660 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NOP9-202ENST00000396802 1942 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TCP11-228ENST00000611141 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 APLP2-210ENST00000528499 2530 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 CHPF-201ENST00000243776 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL031284.1-201ENST00000419297 478 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 C1orf109-203ENST00000464085 919 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AL162171.1-201ENST00000556328 718 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC127496.4-201ENST00000571591 549 ntTSL 4 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TEX264-215ENST00000611400 1488 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NKIRAS1-207ENST00000437230 1898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MEST-201ENST00000223215 2465 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 FAM117B-201ENST00000392238 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AATF-208ENST00000619387 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MARK4-210ENST00000620044 2105 ntTSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SLC39A5-201ENST00000266980 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 HEXB-207ENST00000511181 2021 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SLC16A5-203ENST00000538213 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PRICKLE4-204ENST00000458694 1646 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC17.47■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NOM1-201ENST00000275820 6077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ADAMTS8-201ENST00000257359 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MACROD2-201ENST00000217246 4994 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SMPD3-211ENST00000568373 2073 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PRRT2-212ENST00000636619 2065 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 NRXN1-208ENST00000405472 5724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC020763.4-201ENST00000623414 4170 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 DNM1-211ENST00000627061 2724 ntTSL 5 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 UBE2QL1-201ENST00000399816 4317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 AC135050.7-201ENST00000624508 2218 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ZHX1-C8orf76-201ENST00000357082 1257 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 MPIG6B-210ENST00000480039 790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.46■□□□□ 0.39
TRIM23P36406 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC17.46■□□□□ 0.39
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27 ms