Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC091180.3-201ENST00000506504 963 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DUTP2-201ENST00000519164 463 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC008735.5-201ENST00000623544 497 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 HCCS-201ENST00000321143 2277 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 OR6D1P-202ENST00000641007 5290 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 STRADB-202ENST00000392249 2190 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 USP49-202ENST00000373010 2446 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC087457.1-201ENST00000503496 2727 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 KDM4B-202ENST00000381759 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MOV10L1-203ENST00000395852 1422 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AL355315.1-201ENST00000370649 1848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SYTL1-208ENST00000543823 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PTBP1-220ENST00000627714 2201 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 GTPBP8-203ENST00000383678 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ITGBL1-202ENST00000376180 2494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PMS2P7-201ENST00000506558 1336 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ISLR2-208ENST00000565159 2824 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 EVI5L-201ENST00000270530 3855 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DIAPH2-205ENST00000373061 4983 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DNAH14-205ENST00000366850 1103 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 OTOS-202ENST00000391989 645 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC105339.3-201ENST00000560043 636 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SLC26A1-205ENST00000622731 1057 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 IQSEC2-210ENST00000639161 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SENP6-201ENST00000327284 2700 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ADM-208ENST00000534464 1640 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ZBTB48-202ENST00000377674 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 LBHD1-210ENST00000532208 1508 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 TJP1-208ENST00000495972 2890 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 TUBA4A-201ENST00000248437 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
OTX2P32243 GNAZ-203ENST00000615612 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PPP2R2C-206ENST00000507294 1667 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CDK5R1-201ENST00000313401 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC079776.2-201ENST00000641154 1609 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 C2orf27B-201ENST00000623129 1325 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 LTBP3-217ENST00000530785 2461 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 COLEC11-202ENST00000349077 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 C6orf48-203ENST00000375638 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 C6orf48-207ENST00000375642 962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CENPM-204ENST00000402420 688 ntTSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 GSTZ1-207ENST00000553586 979 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AL049869.3-201ENST00000554918 558 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FUT6-212ENST00000592563 1095 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ADCY6-202ENST00000357869 5748 ntTSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 ADCY3-201ENST00000260600 5050 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 TPGS2-219ENST00000593035 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 CD55-206ENST00000391921 2433 ntTSL 1 (best) BASIC16.53■□□□□ 0.24
OTX2P32243 SLC35F5-201ENST00000245680 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 VIM-201ENST00000224237 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 AC004817.3-201ENST00000602957 2129 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 LIPG-203ENST00000577628 2323 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 DMAP1-201ENST00000315913 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 PDLIM4-201ENST00000253754 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
OTX2P32243 LRCH3-207ENST00000441090 2034 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.5 ms