Protein–RNA interactions for Protein: P31275

HOXC12, Homeobox protein Hox-C12, humanhuman

Predictions only

Length 282 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXC12P31275 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AL449423.1-201ENST00000578935 435 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TRAPPC12-201ENST00000324266 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TMEM237-213ENST00000621467 1824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ADARB2-203ENST00000381312 8421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 RAD51-203ENST00000423169 1611 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 DISC1-204ENST00000366633 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 DISC1-214ENST00000539444 2658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TOP1MT-218ENST00000523676 1982 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ARSE-201ENST00000381134 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SYNE4-201ENST00000324444 1354 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 UPP1-203ENST00000395564 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 MTDH-203ENST00000519934 2184 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 WWOX-203ENST00000406884 1701 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 RPS19BP1-201ENST00000334678 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CELA2A-201ENST00000359621 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AL049795.1-201ENST00000373604 642 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 RAB24-204ENST00000393611 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 KRT18P13-201ENST00000400056 1290 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AC008481.3-201ENST00000585656 727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SALRNA1-201ENST00000555871 2086 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ZNF398-202ENST00000475153 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 HOXC11-201ENST00000243082 2039 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AP5S1-201ENST00000246041 1960 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 BSG-201ENST00000333511 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 NCK1-207ENST00000481752 1971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SLC30A1-201ENST00000367001 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 SPNS1-204ENST00000352260 1948 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CPEB2-209ENST00000538197 6878 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CRTC3-208ENST00000560098 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 GPATCH3-201ENST00000361720 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 STAC3-201ENST00000332782 1656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 TAX1BP3-202ENST00000611779 1302 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 FAM189B-204ENST00000368368 2609 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 NR1H2-210ENST00000598168 1915 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 EXOSC5-201ENST00000221233 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 NT5E-202ENST00000369646 974 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 OLFM1-207ENST00000371801 568 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 MINOS1P3-201ENST00000457048 203 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AC074051.2-201ENST00000565115 352 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 AC004130.1-202ENST00000603156 666 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HOXC12P31275 ATP1B1-201ENST00000367815 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ADGRG2-208ENST00000379873 4698 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RNF139-201ENST00000303545 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 SSFA2-201ENST00000320370 4965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 CHRAC1-201ENST00000220913 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 LRP3-201ENST00000253193 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 NAB2-201ENST00000300131 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ASCC1-205ENST00000394919 2683 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 PSMD8-207ENST00000592035 1581 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 ATP6V1D-201ENST00000216442 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 STX8-201ENST00000306357 1246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 VAMP5-201ENST00000306384 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AC138894.3-201ENST00000603787 634 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 HSP90B1-211ENST00000640977 1127 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 STK24-203ENST00000397517 4578 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 STARD7-AS1-202ENST00000446816 1527 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HOXC12P31275 METTL21A-208ENST00000448007 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.4 ms