Protein–RNA interactions for Protein: P28749

RBL1, Retinoblastoma-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,068 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBL1P28749 RPRD1A-201ENST00000357384 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 UNC5B-201ENST00000335350 6841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC093585.1-201ENST00000425183 428 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NDUFA13-201ENST00000428459 576 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC011498.3-201ENST00000590159 569 ntTSL 4 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RTBDN-213ENST00000592204 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 GAL3ST1-201ENST00000338911 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 BSCL2-201ENST00000278893 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SH3BP5-203ENST00000408919 1880 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RDH8-203ENST00000591589 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RBL1P28749 IQGAP2-201ENST00000274364 5844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MAZ-212ENST00000568282 1593 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RNF222-201ENST00000344001 2786 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CDH24-201ENST00000267383 2873 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 KIF25-203ENST00000443060 1613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 Z83836.1-201ENST00000624605 1642 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MTCL1P1-201ENST00000446207 792 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC022616.7-201ENST00000525383 220 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PHB2-207ENST00000542912 1138 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PSMD8-202ENST00000585598 541 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 EML2-AS1-203ENST00000623430 886 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 WDR6-223ENST00000627177 207 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CDK2AP2-201ENST00000301488 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CLEC4G-201ENST00000328853 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 KCNK7-204ENST00000394217 1372 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NGFR-202ENST00000504201 1840 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 GGNBP2-212ENST00000613102 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 LINC00921-202ENST00000573951 2468 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RBCK1-215ENST00000640614 2599 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 LEXM-201ENST00000358193 1777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ZACN-201ENST00000334586 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CRKL-201ENST00000354336 5325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 OLA1-201ENST00000284719 4417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NUDC-201ENST00000321265 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ZNF414-201ENST00000255616 1178 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RHEBL1-201ENST00000301068 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CLN3-202ENST00000355477 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 C6orf48-206ENST00000375641 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 DCTN5-208ENST00000568589 772 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 LINC01451-201ENST00000623792 534 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RNPS1-202ENST00000320225 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 TCF4-201ENST00000354452 3482 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 LINC00937-205ENST00000538304 2157 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SLCO4A1-202ENST00000370507 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ZNF280D-205ENST00000559000 4726 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CERCAM-202ENST00000372842 5201 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RBL1P28749 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 C8orf33-201ENST00000331434 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CCM2-207ENST00000475551 2471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 INF2-204ENST00000398337 1689 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AP001625.2-201ENST00000442605 575 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AL671277.2-201ENST00000458060 996 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 AF250324.1-201ENST00000506276 703 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 DUX4-205ENST00000570263 768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RBL1P28749 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms