Protein–RNA interactions for Protein: P26358

DNMT1, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,616 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DNMT1P26358 SH3BP1-201ENST00000357436 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SCHIP1-205ENST00000482804 1799 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 C8orf58-207ENST00000615223 1848 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TREX2-201ENST00000330912 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TMEM147-201ENST00000222284 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MAPRE3-201ENST00000233121 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 PNPLA2-201ENST00000336615 2428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 YIF1B-203ENST00000339413 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CD244-202ENST00000368033 1360 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 NPR3-203ENST00000415167 1753 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 NDOR1-203ENST00000427047 2315 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TREML1-203ENST00000437044 647 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 HCG4B-203ENST00000450128 991 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CAPN5-205ENST00000529629 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AL109827.1-203ENST00000541176 872 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MCCC2-209ENST00000629193 1128 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 GCSH-208ENST00000639169 2537 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 LSM12-201ENST00000293406 2308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SYNGR2-206ENST00000589711 2041 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 NR1H3-202ENST00000405576 1352 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SOD2-215ENST00000546087 2558 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 EIF6-202ENST00000374443 1017 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 DKK3-202ENST00000396505 2650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SDC2-202ENST00000518385 1583 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 RTN4-201ENST00000317610 2333 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SLC12A9-215ENST00000540482 2269 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 LRRC4B-201ENST00000389201 2958 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 HMGCLL1-202ENST00000308161 1314 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MYCLP1-201ENST00000372451 1075 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 LYPLA2-204ENST00000374505 907 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TIMM17B-208ENST00000495490 939 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 AC027243.1-201ENST00000559539 758 ntTSL 3 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 MTDHP5-201ENST00000598980 586 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
DNMT1P26358 TTC29-201ENST00000325106 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 TTC29-205ENST00000504425 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 IGHV3-52-201ENST00000519770 353 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 MIOX-202ENST00000395732 1658 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 TBPL1-208ENST00000613034 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 AFDN-201ENST00000344191 5249 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 LHFPL6-201ENST00000379589 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 GGNBP2-210ENST00000611219 2315 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 SLBP-202ENST00000429429 1623 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 AC005281.1-201ENST00000433040 911 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 RNH1-201ENST00000354420 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 ST8SIA4-202ENST00000451528 1794 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 TWF1-201ENST00000395510 3045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 HLA-A-204ENST00000396634 1868 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 SREK1-216ENST00000612404 2128 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 WIPF1-206ENST00000409891 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 ATP5G3-202ENST00000392541 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 COPS7B-207ENST00000410024 1103 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 HTR5BP-201ENST00000430851 1154 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 AC018845.2-201ENST00000568326 409 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 NEU4-203ENST00000404257 2352 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 PLD3-207ENST00000409735 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 TRAF3-203ENST00000392745 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
DNMT1P26358 CRMP1-201ENST00000324989 3146 ntTSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms