Protein–RNA interactions for Protein: P23467

PTPRB, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase beta, humanhuman

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Length 1,997 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRBP23467 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC040963.1-202ENST00000589729 644 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 OARD1-216ENST00000628419 1188 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 HFE2-206ENST00000634927 506 ntTSL 4 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ABI3-202ENST00000419580 1718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FAM234A-202ENST00000301679 1936 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 METRNL-203ENST00000571814 1900 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MLX-201ENST00000246912 2586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ANKMY1-209ENST00000405523 1827 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SIGLEC14-201ENST00000360844 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 YBX3-201ENST00000228251 1796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 NME1-NME2-202ENST00000393193 1021 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AHSA1-202ENST00000535854 1173 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SLC25A39P2-201ENST00000537614 270 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 STARD3-201ENST00000336308 2132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CCNL2-201ENST00000400809 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 AC090286.1-201ENST00000354432 1489 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MTX1-207ENST00000609421 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TCF7-201ENST00000342854 3045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 TFAP4-201ENST00000204517 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 USP39-201ENST00000323701 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
PTPRBP23467 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GDPD1-201ENST00000284116 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 NLRP6-201ENST00000312165 2679 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PPP1R7-202ENST00000272983 1954 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 SPEM1-201ENST00000323675 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 IQSEC2-204ENST00000485377 835 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FBXO4-206ENST00000509134 1284 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC243571.2-201ENST00000615265 628 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CD1E-205ENST00000368160 1727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TBC1D10C-209ENST00000542590 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LRRC27-201ENST00000344079 1809 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MFSD11-219ENST00000593181 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PTCHD3P3-201ENST00000403073 906 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 HLA-V-201ENST00000429037 534 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MAGEF1-201ENST00000317897 1636 ntAPPRIS P1 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RBM6-204ENST00000422955 2324 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 PLA2G7-201ENST00000274793 1882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 KLC1-217ENST00000554280 2426 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 LACTB-202ENST00000413507 2978 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TIMM13-202ENST00000591871 631 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 RASGRP2-211ENST00000394432 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TEPSIN-213ENST00000637944 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 WNT7B-202ENST00000409496 2285 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CXXC1-202ENST00000412036 2280 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 TCTN1-204ENST00000397659 1885 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FCMR-201ENST00000367091 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 ISCA1-203ENST00000375991 1958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 SPOCK3-215ENST00000510741 1963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 FXR2-201ENST00000250113 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
PTPRBP23467 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
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