Protein–RNA interactions for Protein: P22736

NR4A1, Nuclear receptor subfamily 4 group A member 1, humanhuman

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NR4A1P22736 PHOSPHO2-206ENST00000616481 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 PHOSPHO2-208ENST00000617738 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ATG4B-226ENST00000625810 370 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 GLDC-219ENST00000640208 420 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 APIP-201ENST00000395787 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 PHB2-203ENST00000535923 1515 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SH2D2A-201ENST00000368198 1599 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ST3GAL6-214ENST00000483910 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 FAM53A-205ENST00000472884 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ABHD18-203ENST00000444616 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AC104809.2-201ENST00000418218 2274 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ANAPC2-201ENST00000323927 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SH2D3C-205ENST00000420366 2682 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SCUBE2-207ENST00000520467 3148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 KCNMA1-261ENST00000639486 8850 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 FAM46A-201ENST00000320172 5609 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 KDM4B-201ENST00000159111 5593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 MGEA5-203ENST00000370094 3314 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 GMIP-204ENST00000587238 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 PCNP-201ENST00000265260 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TTLL10-202ENST00000379289 2259 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 MST1L-201ENST00000442552 2185 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ACSM2B-208ENST00000565322 1834 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 HLA-DQB1-201ENST00000374943 1656 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 C18orf21-205ENST00000592875 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 WDR37-206ENST00000620998 1303 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 KRAS-201ENST00000256078 1119 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 HBA1-201ENST00000320868 577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 KRT8P12-201ENST00000468527 998 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AC003982.1-201ENST00000477404 484 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 REPIN1-210ENST00000482680 1029 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 CHCHD10-202ENST00000484558 1171 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 BNIP3L-204ENST00000520409 739 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ZNF503-201ENST00000372524 3347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 PTPN21-208ENST00000556564 6166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ADGRB2-212ENST00000527361 4919 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 GLB1-202ENST00000307377 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ISM2-207ENST00000493585 1739 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TJP1-212ENST00000614355 6977 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 NEK10-202ENST00000341435 2638 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SLC25A39-202ENST00000377095 1565 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 CYP46A1-202ENST00000380228 1597 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AC006116.8-202ENST00000587620 1550 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 HSD11B1L-221ENST00000583928 1319 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AQP12B-201ENST00000407834 1094 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AC005056.1-201ENST00000435932 532 ntTSL 4 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SMIM1-201ENST00000444870 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 KCNMA1-220ENST00000481070 896 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ANK1-211ENST00000522231 1060 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ANK1-212ENST00000522543 1160 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SLC25A1P4-201ENST00000567977 778 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 CDKN2A-213ENST00000579122 666 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AP005242.2-201ENST00000580065 1175 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 OAZ1-211ENST00000602676 1148 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TJP2-202ENST00000377245 4611 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TBXAS1-206ENST00000425687 2080 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SNX17-201ENST00000233575 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 FTSJ1-201ENST00000019019 1986 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 EHMT1-204ENST00000462484 2707 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SEMA6C-210ENST00000621728 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 C18orf63-201ENST00000579455 5127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 MINOS1-NBL1-204ENST00000602662 1623 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 MFSD10-205ENST00000507555 1573 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ARHGAP6-202ENST00000337414 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 ZNF302-202ENST00000446502 2635 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SAYSD1-201ENST00000229903 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 AL096828.2-201ENST00000567259 1965 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
NR4A1P22736 SLC25A3-211ENST00000548847 1369 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.1 ms