Protein–RNA interactions for Protein: P20132

SDS, L-serine dehydratase/L-threonine deaminase, humanhuman

Predictions only

Length 328 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SDSP20132 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 SMPD3-201ENST00000219334 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 GPR32-201ENST00000270590 1269 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 BX890604.1-205ENST00000425492 856 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 AC099669.1-201ENST00000457331 456 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 RN7SL606P-201ENST00000472779 293 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 GGTLC2-203ENST00000480559 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 EEF1D-243ENST00000532400 419 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 LINC01582-202ENST00000561215 452 ntTSL 4 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 GEMIN7-203ENST00000591607 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 AC011511.2-201ENST00000592893 918 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 AC020916.1-201ENST00000587762 1774 ntBASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 SNX2-213ENST00000514949 2119 ntTSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 SEMA6B-201ENST00000586582 3986 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 PTGDR-201ENST00000306051 2942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 PFDN6-206ENST00000463584 1915 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SDSP20132 PLCG1-AS1-201ENST00000454626 1462 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDSP20132 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDSP20132 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDSP20132 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDSP20132 TFAP2E-201ENST00000373235 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SDSP20132 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 GRAMD1B-214ENST00000635736 2814 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 AL034417.2-201ENST00000445300 2044 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 MRPS34-201ENST00000177742 1040 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 NFU1-202ENST00000394305 1058 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 KRT8P26-201ENST00000534154 1276 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 Z94160.2-201ENST00000609322 910 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 TBC1D9B-220ENST00000630103 303 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 ARID1B-220ENST00000636930 8246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 PSMA1-209ENST00000530457 1527 ntTSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 TOM1L2-203ENST00000395739 1766 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SDSP20132 ACBD6-201ENST00000367595 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 EPB41L5-203ENST00000443124 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 SLC4A4-201ENST00000264485 5852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 MRPL4-203ENST00000393733 1620 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 AC093627.4-201ENST00000484550 5008 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 AC242426.3-201ENST00000440377 1571 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 PCED1CP-201ENST00000419887 785 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 LINC01770-202ENST00000430109 510 ntTSL 3 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 AC010331.1-201ENST00000611423 582 ntBASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 UBE3C-201ENST00000348165 5229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 ZDHHC23-201ENST00000330212 3778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 FMN2-201ENST00000319653 6434 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 IQSEC1-201ENST00000273221 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 LRRC29-201ENST00000393992 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 RUSC1-214ENST00000490373 1700 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 HNRNPD-201ENST00000313899 3033 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 FMR1-205ENST00000370475 4308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 TPR-209ENST00000613151 2478 ntTSL 5 BASIC21.63■■□□□ 1.05
SDSP20132 IDS-202ENST00000370441 1399 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 OPRK1-202ENST00000520287 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 NPTN-202ENST00000351217 2817 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 P2RX6-201ENST00000401443 1834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 MSC-201ENST00000325509 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 SH2D3C-213ENST00000629203 2478 ntTSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 GGN-201ENST00000334928 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 KHDC1-201ENST00000257765 1134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 LCN8-201ENST00000371688 867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 RNF216P1-205ENST00000406089 807 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 IFNLR1-205ENST00000374421 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SDSP20132 SEL1L3-202ENST00000399878 4520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
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