Protein–RNA interactions for Protein: P19961

AMY2B, Alpha-amylase 2B, humanhuman

Predictions only

Length 511 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AMY2BP19961 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 FGF8-202ENST00000344255 707 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 BEX3-204ENST00000372645 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ST8SIA1-202ENST00000381424 1036 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL445472.1-201ENST00000452532 1007 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC008825.1-201ENST00000504398 452 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 LINC01385-201ENST00000512310 780 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 DYNLL1-205ENST00000548342 662 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 C14orf144-201ENST00000553757 537 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC104390.1-201ENST00000555663 520 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GCSHP2-201ENST00000560971 527 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 CENPS-CORT-205ENST00000602787 571 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AC011558.1-201ENST00000623459 338 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RAP1GDS1-201ENST00000264572 1686 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 ITSN1-209ENST00000399352 5408 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 RGS3-211ENST00000462403 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 AL512380.2-201ENST00000637901 1780 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 EDEM1-204ENST00000445686 1363 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
AMY2BP19961 GATA2-203ENST00000487848 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ENDOV-225ENST00000522751 1475 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PLA2G4C-222ENST00000599921 1984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 OSR2-201ENST00000297565 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RNPS1-205ENST00000561718 1806 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MAGED2-213ENST00000627068 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RNF2-201ENST00000367509 1677 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 KLHDC4-227ENST00000622456 1422 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TLK2-201ENST00000326270 3512 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CADM3-201ENST00000368124 2546 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CD24-204ENST00000619133 2513 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SCARF1-205ENST00000571272 2871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TMEM176A-210ENST00000484928 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AZU1-201ENST00000233997 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SYCE1L-201ENST00000378644 858 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AL161452.1-201ENST00000415062 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CT47A4-201ENST00000415858 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CT47A9-201ENST00000417256 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CT47A6-201ENST00000419194 1298 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CT47A10-201ENST00000430448 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CT47A5-201ENST00000439466 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CT47A3-201ENST00000441330 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CT47A8-201ENST00000457977 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CT47A2-201ENST00000458218 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 C7orf49-209ENST00000483029 596 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 YBX1P2-201ENST00000489612 999 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 KRT18P21-201ENST00000515767 1272 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 C12orf43-206ENST00000537817 1270 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CENPX-206ENST00000580435 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SLC7A5-201ENST00000261622 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ACBD5-201ENST00000375888 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 NRXN1-204ENST00000401669 5870 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SFT2D3-201ENST00000310981 3735 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 RBM17-201ENST00000379888 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MRGPRF-AS1-201ENST00000538407 1490 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CASK-203ENST00000378163 4411 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC106820.2-201ENST00000563775 3264 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 NME9-203ENST00000383180 2133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GAMT-202ENST00000447102 1769 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 EPHX4-201ENST00000370383 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FAM3A-204ENST00000369643 1521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CDX4-201ENST00000373514 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 WDFY4-202ENST00000360890 2193 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PCED1A-201ENST00000356872 1706 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MLLT10-205ENST00000377100 1136 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 AC103564.1-201ENST00000437330 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MAP3K13-213ENST00000454237 526 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZNF706-206ENST00000519744 785 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 MRPL46-202ENST00000558531 1002 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 UQCR11-201ENST00000585671 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CD177-202ENST00000607855 536 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 GINM1-201ENST00000367419 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 CLPB-212ENST00000543042 2133 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
AMY2BP19961 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms