Protein–RNA interactions for Protein: P14867

GABRA1, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 456 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA1P14867 C6orf118-201ENST00000230301 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 COPS7A-210ENST00000539735 1832 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TBXA2R-204ENST00000589966 1814 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ADNP2-201ENST00000262198 5393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PTRHD1-201ENST00000328379 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 METTL21A-205ENST00000426075 1051 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DANCR-204ENST00000444958 709 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 RDH5-202ENST00000547072 1054 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PDCD2L-203ENST00000587065 492 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ABHD17A-204ENST00000590661 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FLT3LG-206ENST00000597551 951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC104692.2-201ENST00000603054 253 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AL591684.3-201ENST00000605187 298 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DSCR9-201ENST00000454482 1644 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ADRA1A-205ENST00000380582 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PTTG1IP-203ENST00000397887 2413 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CIAO1-203ENST00000488633 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 INPP4A-204ENST00000409540 3231 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 BRMS1L-201ENST00000216807 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 GABRG3-206ENST00000555083 1405 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DKK1-201ENST00000373970 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DGKI-203ENST00000446122 4070 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FFAR2-202ENST00000599180 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SETD3-201ENST00000329331 1330 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CDH24-204ENST00000487137 3438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SDK1-202ENST00000404826 10397 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DMRT3-201ENST00000190165 2183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 BFSP1-201ENST00000377868 2063 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TRIM41-202ENST00000351937 2696 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 NIFK-201ENST00000285814 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TOR3A-203ENST00000367627 2724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 GYG2P1-201ENST00000357871 623 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 C1orf43-204ENST00000368518 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC079781.3-201ENST00000449110 356 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC068472.1-201ENST00000474589 881 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC091607.1-201ENST00000490318 1060 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 RBM14-RBM4-203ENST00000500635 829 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 XYLT2-203ENST00000507602 2107 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 COX5A-204ENST00000567270 579 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ASF1B-205ENST00000592798 769 ntTSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 LINC00454-206ENST00000609861 841 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC114341.1-201ENST00000618070 349 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CEACAM3-208ENST00000630848 1110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 STK11-201ENST00000326873 2611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PHYKPL-201ENST00000308158 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FAM49B-214ENST00000519540 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ST6GALNAC6-201ENST00000291839 2280 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ADAM15-207ENST00000368413 1901 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 NECTIN3-206ENST00000485303 3664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ARPC4-201ENST00000397261 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 UBE2I-207ENST00000406620 1842 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MXRA8-202ENST00000342753 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 FBXW11-202ENST00000296933 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TPSD1-201ENST00000211076 1499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ARHGEF19-201ENST00000270747 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TDRKH-207ENST00000458431 2768 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 TEFM-205ENST00000581216 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 DLK1-202ENST00000341267 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SGSM2-202ENST00000426855 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 UNKL-204ENST00000389221 5116 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 BUB3-201ENST00000368858 1361 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 MCOLN1-201ENST00000264079 2082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SDCBP-202ENST00000413219 2086 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 GNG5-202ENST00000370645 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 BNIP3P18-201ENST00000593976 575 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 HNF4A-208ENST00000609795 1192 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
GABRA1P14867 SPAG6-203ENST00000376624 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms