Protein–RNA interactions for Protein: P14373

TRIM27, Zinc finger protein RFP, humanhuman

Predictions only

Length 513 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM27P14373 TSFM-208ENST00000543727 651 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 TNNT1-204ENST00000585321 995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 TMIGD2-202ENST00000595645 1212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SPINK2-207ENST00000631082 392 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 KDM5C-203ENST00000375383 5122 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 CCDC120-206ENST00000603986 2379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SENP6-202ENST00000370010 4644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 ARPIN-202ENST00000460685 2145 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 LSP1-201ENST00000311604 1699 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SH2D3C-203ENST00000373277 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 CYP11A1-202ENST00000358632 2001 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 LINC01700-201ENST00000433952 1598 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 TFEB-201ENST00000230323 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SMN1-204ENST00000506163 1445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC113382.1-201ENST00000500267 1253 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 BRICD5-203ENST00000566018 555 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC132938.3-201ENST00000579095 357 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 AC092119.3-201ENST00000612618 583 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SOCS3-201ENST00000330871 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
TRIM27P14373 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ALG3-201ENST00000397676 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 MARK1-205ENST00000611084 5321 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AANAT-201ENST00000250615 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 KLHL29-203ENST00000486442 5287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 C14orf93-204ENST00000397377 1776 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SVOPL-204ENST00000436657 1420 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 GUCA1B-201ENST00000230361 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TMEM171-201ENST00000287773 1247 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 EFCAB2-203ENST00000366523 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC115618.1-201ENST00000376775 549 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PON3-205ENST00000451904 1053 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CDV3-207ENST00000508481 661 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC092338.2-202ENST00000567158 611 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ZNF688-207ENST00000567855 540 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NUTF2-205ENST00000568396 1179 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC138207.7-201ENST00000584499 668 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC016590.1-204ENST00000586442 813 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 KISS1R-203ENST00000606939 964 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC005258.1-201ENST00000621615 1268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ALKBH3-201ENST00000302708 1474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TNFAIP2-201ENST00000333007 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CCDC144A-210ENST00000456009 2306 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 DDIT4L-201ENST00000273990 2604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AL355987.1-201ENST00000435202 2420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 HBZ-201ENST00000252951 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 KLC2-201ENST00000316924 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CLDN7-202ENST00000397317 1228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 LINC00265-3P-201ENST00000447588 903 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 CYP1B1-AS1-214ENST00000620177 554 ntTSL 4 BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 LINC00960-201ENST00000463183 1333 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AL138688.1-201ENST00000624851 1594 ntBASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AGAP6-201ENST00000374056 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 PC-208ENST00000529047 1607 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NPTX1-201ENST00000306773 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SCYL2-201ENST00000360820 5779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 MPIG6B-205ENST00000375810 910 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 ENO1-AS1-201ENST00000442636 456 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AK2-204ENST00000467905 880 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 SELENOH-204ENST00000534355 818 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 TXNDC12-205ENST00000610127 806 ntTSL 2 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
TRIM27P14373 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.8 ms