Protein–RNA interactions for Protein: P11836

MS4A1, B-lymphocyte antigen CD20, humanhuman

Predictions only

Length 297 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MS4A1P11836 SPEG-225ENST00000617028 815 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 NBL1-210ENST00000615215 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 BAZ1A-203ENST00000382422 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 HIBCH-201ENST00000359678 1939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PRRT2-219ENST00000637565 1733 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 EP300-201ENST00000263253 9587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CD24-201ENST00000606017 2180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PSMD4-201ENST00000368881 1333 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 GBX2-203ENST00000551105 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 RIMS4-201ENST00000372851 5203 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MAEA-219ENST00000514708 1945 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 NCAN-201ENST00000252575 6387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 METTL5-201ENST00000260953 1010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 COPE-201ENST00000262812 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 GSTO2-201ENST00000338595 1179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 COPE-203ENST00000351079 907 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 HBZP1-201ENST00000354915 429 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 DLEU2-203ENST00000425586 1267 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC092597.1-201ENST00000487352 616 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC092118.1-202ENST00000568697 718 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC004263.2-201ENST00000617183 678 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC006011.2-201ENST00000621313 1158 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ANKRD20A8P-203ENST00000641373 517 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SSB-201ENST00000260956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 DICER1-AS1-204ENST00000554631 1709 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PYCR1-217ENST00000629768 1740 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SWAP70-202ENST00000447399 3538 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 RNF113B-201ENST00000267291 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SLC22A7-201ENST00000372574 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ACOT7-202ENST00000377842 1813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PCK2-205ENST00000558096 2433 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PDE4A-201ENST00000293683 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AL138752.2-201ENST00000540557 2591 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MEPCE-201ENST00000310512 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 RAB8A-201ENST00000300935 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MFSD2A-201ENST00000372809 2173 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TCTEX1D1-201ENST00000282670 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CYP2D6-204ENST00000389970 1714 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 IL27RA-201ENST00000263379 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SUSD4-203ENST00000344029 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TSPY12P-201ENST00000421279 868 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TTTY14-203ENST00000447937 920 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 WDR45-218ENST00000473974 1077 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AP003733.1-201ENST00000491725 852 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PTP4A3-206ENST00000524028 963 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 IFI27L2-206ENST00000556727 556 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SLF2-205ENST00000609386 891 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 LRRFIP2-209ENST00000440230 1989 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC100803.2-201ENST00000562459 1963 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TNRC18P3-201ENST00000441896 2691 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SORCS3-202ENST00000369701 5757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CSK-202ENST00000439220 1900 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CDC73-201ENST00000367435 4969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 TMED3-201ENST00000299705 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 DHRS4L2-203ENST00000534993 1450 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 PSRC1-204ENST00000369909 1742 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 GGA1-203ENST00000343632 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 LINC00683-201ENST00000578803 2221 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 CEACAM16-202ENST00000587331 1692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 EGR2-203ENST00000439032 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 UQCC3-201ENST00000377953 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SELENOF-202ENST00000370554 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC092647.4-201ENST00000457211 535 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MAGEA3-203ENST00000598245 1762 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 MAGEA6-204ENST00000616035 1762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 SASH1-201ENST00000367467 7711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 AC008969.1-203ENST00000313957 1897 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 EMD-202ENST00000369842 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MS4A1P11836 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.6 ms