Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 ACD-215ENST00000620761 1483 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 KCNQ2-207ENST00000370224 3004 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MOS-201ENST00000311923 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 S100A14-201ENST00000344616 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PPIH-202ENST00000372549 327 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ROMO1-205ENST00000397416 288 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 YPEL3-204ENST00000563788 730 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PTX4-201ENST00000293922 1422 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 EIF2B4-210ENST00000493344 1949 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CFC1-202ENST00000615342 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GGT5-201ENST00000263112 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TMEM59L-201ENST00000262817 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CNPY2-201ENST00000273308 1214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SEC61A2-201ENST00000298428 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 REEP4-201ENST00000306306 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SPATA22-202ENST00000355380 1216 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CGB7-201ENST00000377280 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GPR149-201ENST00000389740 2323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 IGHGP-201ENST00000390555 1178 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RASGRP2-208ENST00000394428 444 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RPL32-202ENST00000396953 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 HOXD8-203ENST00000450510 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 HRAT92-201ENST00000452622 3506 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 OSMR-202ENST00000502536 1740 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MPI-205ENST00000562606 1052 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 MLLT1-201ENST00000252674 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 STX2-201ENST00000261653 3331 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 APBB1-215ENST00000608394 2128 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 APBB1-222ENST00000610474 2147 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SUFU-201ENST00000369899 1839 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 UBE2E1-202ENST00000346855 1398 ntTSL 3 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 EIF5-201ENST00000216554 5945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RPH3AL-222ENST00000618002 2578 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 STXBP2-201ENST00000221283 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC004890.2-201ENST00000426347 2419 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SPRED3-201ENST00000338502 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RNF144A-201ENST00000320892 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ALDH3B1-204ENST00000614849 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 KSR1-201ENST00000268763 2806 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ZBTB4-201ENST00000311403 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CTSA-204ENST00000372484 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 GLCCI1-201ENST00000223145 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TMEM222-201ENST00000374076 1599 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 RPL3-201ENST00000216146 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ACSL6-205ENST00000379246 2622 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 INS-201ENST00000250971 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CDC26-201ENST00000374206 872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TPSP2-201ENST00000561760 610 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 BIRC5-207ENST00000590449 568 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ASAH1-251ENST00000637561 929 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TLE4-205ENST00000376544 4871 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 SLC23A3-207ENST00000455516 2048 ntTSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 EPS8L2-205ENST00000526198 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 AC027097.1-202ENST00000592201 1954 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 KDELC1-201ENST00000376004 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
ITGAMP11215 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 22.1 ms