Protein–RNA interactions for Protein: P0DMS9

TMIGD3, Transmembrane domain-containing protein TMIGD3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 266 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMIGD3P0DMS9 MIR3936HG-202ENST00000457998 733 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 RPP14-206ENST00000466547 805 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ENDOV-205ENST00000518644 625 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 COX6C-204ENST00000520271 571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CMTM1-213ENST00000529506 581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AP000721.2-201ENST00000537170 650 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ASZ1-201ENST00000284629 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 FIBCD1-201ENST00000372337 1868 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 THOP1-205ENST00000586677 1872 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 UNC5D-202ENST00000404895 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SKOR1-202ENST00000380035 3675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 HMGA1-201ENST00000311487 1920 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DPYSL4-202ENST00000368627 1545 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NSUN5P1-202ENST00000421140 1535 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NSUN5P2-203ENST00000457352 1529 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 RHOB-201ENST00000272233 2372 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MATN4-205ENST00000537548 1991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 C1orf159-204ENST00000379339 2429 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NAA50-209ENST00000497525 1385 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 GTPBP8-208ENST00000619116 1378 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 GPS1-201ENST00000306823 1842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ST8SIA5-201ENST00000315087 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PABPC1L-217ENST00000537323 1910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TPM1-203ENST00000317516 738 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NPFFR2-202ENST00000344413 1234 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 IGHV3-47-201ENST00000425060 335 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 POLR2M-203ENST00000464277 910 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CCDC61-201ENST00000536603 1282 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TPM1-218ENST00000559281 851 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 WDR88-203ENST00000592765 651 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 KLK8-205ENST00000593490 267 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 FCGRT-210ENST00000596975 1054 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 RPS6KA5-201ENST00000418736 2249 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 KAZN-203ENST00000376030 6030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ISG20-201ENST00000306072 1856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 UNC5CL-202ENST00000373164 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PTPN6-204ENST00000456013 2389 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AL024508.2-201ENST00000607749 1894 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CLMP-201ENST00000448775 5072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PSTK-201ENST00000368887 1705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 NSFL1C-206ENST00000476071 2800 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 COL18A1-202ENST00000355480 5924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 STARD10-218ENST00000543304 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ANKS1A-201ENST00000360359 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CCDC134-201ENST00000255784 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ANKRD37-201ENST00000335174 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 S100A3-201ENST00000368712 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 BOLA1-201ENST00000369150 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ETNK2-203ENST00000367202 2434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 GUCA1A-202ENST00000372958 1575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 STYXL1-208ENST00000451157 1570 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CCT6P1-202ENST00000442266 1317 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 EMB-204ENST00000508934 1617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ZNF133-211ENST00000538547 2245 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CHRD-202ENST00000348986 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 LRRC61-201ENST00000323078 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SNX27-203ENST00000368843 7197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DYNLL1-209ENST00000550845 1376 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 BMS1P4-202ENST00000584747 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ZNF114-206ENST00000600687 1742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC063977.6-201ENST00000600074 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 AC060780.1-201ENST00000635600 1782 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SLC30A2-202ENST00000374278 3097 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ACTN4-202ENST00000390009 2102 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ZNF12-204ENST00000405858 5051 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 PSMD11-202ENST00000457654 2159 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 APOA5-201ENST00000227665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 DAG1-220ENST00000539901 5665 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 TLE3-214ENST00000558939 6004 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CHUK-201ENST00000370397 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CACNA1A-227ENST00000636549 6792 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ARHGEF2-204ENST00000368315 1645 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 ASL-205ENST00000395332 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 BIRC7-203ENST00000395306 593 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TMIGD3P0DMS9 CRELD2-202ENST00000403427 1242 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.8 ms