Protein–RNA interactions for Protein: P02549

SPTA1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPTA1P02549 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 OSM-201ENST00000215781 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 VAV2-203ENST00000406606 4691 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SAAL1-201ENST00000300013 1518 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 NR1H2-211ENST00000599105 1830 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SLC25A47-201ENST00000361529 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SDCBP2-201ENST00000339987 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 STRADB-201ENST00000194530 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 HSPB9-201ENST00000565659 1922 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 UBE2I-203ENST00000397514 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CARHSP1-219ENST00000618335 2972 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 KIFC3-201ENST00000379655 3427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CSPG5-203ENST00000456150 2089 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 RPA2-202ENST00000373909 1162 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 TIMM17B-202ENST00000396779 1099 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC007967.3-201ENST00000434308 558 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PRICKLE2-AS1-203ENST00000476308 623 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 HDDC2-203ENST00000608284 538 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 HAUS8-202ENST00000448593 1545 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MMP11-201ENST00000215743 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ANKRD13D-201ENST00000308440 2219 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PSMC5-202ENST00000375812 1494 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 KMT5B-206ENST00000405515 2869 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MAP7-206ENST00000611373 2317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 TM7SF3-201ENST00000343028 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SP3-203ENST00000418194 3937 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC093484.2-201ENST00000580996 2166 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 LRR1-201ENST00000298288 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 IGLL3P-201ENST00000412472 434 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC009102.3-201ENST00000623118 1491 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC132938.6-201ENST00000623828 1655 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 EFS-203ENST00000429593 2610 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 COA5-201ENST00000328709 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 COPS7A-222ENST00000626119 1768 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ZDHHC11-209ENST00000511539 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ZDHHC11B-204ENST00000622126 1301 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 RNF135-205ENST00000535306 2098 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 DMD-208ENST00000378680 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CACNB3-202ENST00000536187 1872 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MAN2A1-201ENST00000261483 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CXCL16-201ENST00000293778 2222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MIR6799-201ENST00000620297 69 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CCDC78-201ENST00000293889 1611 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SOX2-201ENST00000325404 2513 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 DUOXA1-201ENST00000267803 1996 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 TBC1D1-203ENST00000402522 1567 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 HOOK1-201ENST00000371208 5857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SLC34A3-202ENST00000538474 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ESM1-201ENST00000381403 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PTHLH-203ENST00000395872 1318 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PRELID3B-201ENST00000355937 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 DTX2-212ENST00000446820 1770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 PTHLH-206ENST00000538310 854 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AL583722.3-202ENST00000554954 486 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 AC051619.7-201ENST00000568314 623 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 DCTPP1-204ENST00000568434 853 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SAMD11-211ENST00000616125 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 MRM2-203ENST00000440306 1570 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 SNTB1-201ENST00000395601 5164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 KLHL2-201ENST00000226725 3134 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 LUC7L-221ENST00000629543 1520 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
SPTA1P02549 ASCL4-201ENST00000342331 2260 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms