Protein–RNA interactions for Protein: O94966

USP19, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 19, humanhuman

Predictions only

Length 1,318 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP19O94966 ADAM33-202ENST00000356518 3677 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 NFATC4-220ENST00000555393 2235 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
USP19O94966 GABBR2-201ENST00000259455 5788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 RTEL1-204ENST00000370003 2273 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 FOXI1-201ENST00000306268 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 TMEM175-222ENST00000622959 1967 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 ZGPAT-202ENST00000355969 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 FAM72B-207ENST00000619376 1659 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 RPS15P9-201ENST00000494093 319 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC119403.1-201ENST00000520090 776 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 AL442663.3-201ENST00000554737 1000 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 RIN3-211ENST00000557762 517 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC104581.1-202ENST00000635932 2618 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 CCKBR-203ENST00000525462 2138 ntTSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 DFNA5-203ENST00000409970 2005 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 FAM50B-202ENST00000380274 1932 ntAPPRIS P1 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 PTPRJ-208ENST00000615445 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 OTOP2-202ENST00000580223 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 AGPAT5-201ENST00000285518 3685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 CD19-202ENST00000538922 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC009113.1-201ENST00000570267 2443 ntBASIC23.92■■□□□ 1.42
USP19O94966 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 PRSS23-209ENST00000533902 2043 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 NFKBIB-202ENST00000392079 991 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 CCNL2-202ENST00000408918 1186 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 CRYGEP-201ENST00000412192 528 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC093714.2-201ENST00000489626 763 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 MIR4751-201ENST00000578027 74 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 AGAP4-201ENST00000311652 2715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 EMX2-203ENST00000553456 2897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 COPS7A-204ENST00000534947 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 ADAD1-203ENST00000388725 1918 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
USP19O94966 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 TGFBR1-202ENST00000374994 6516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 DNAAF4-202ENST00000348518 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 LINC00899-202ENST00000444890 493 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC007192.2-201ENST00000600364 463 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC019129.2-201ENST00000609837 1235 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 AL078644.1-201ENST00000609881 752 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 SIRPAP1-201ENST00000448467 1770 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 TTLL10-203ENST00000379290 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 ANKS3-202ENST00000446014 2265 ntTSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 FIP1L1-203ENST00000358575 2180 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 RAPGEF5-203ENST00000405243 2800 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 ZNF302-206ENST00000505242 2849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 TAF6-211ENST00000453269 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 ADAMTS9-202ENST00000459780 2871 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC002310.2-202ENST00000492040 1488 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 CHTF8-203ENST00000448552 2903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
USP19O94966 GRK6-202ENST00000355958 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 DCLK2-207ENST00000635524 2153 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 OARD1-201ENST00000373154 1129 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 ZFPM1-203ENST00000562437 502 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 AC005306.1-201ENST00000587498 661 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 AL805961.1-202ENST00000641562 540 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 FAM213A-206ENST00000615554 2213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
USP19O94966 PHGDH-209ENST00000641074 1780 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
USP19O94966 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP19O94966 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP19O94966 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP19O94966 ZBTB10-205ENST00000610895 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP19O94966 POLD3-203ENST00000527458 2122 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP19O94966 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
USP19O94966 ZNF296-201ENST00000303809 1744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP19O94966 LINC01819-201ENST00000422351 2156 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP19O94966 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP19O94966 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
USP19O94966 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.2 ms