Protein–RNA interactions for Protein: O75884

RBBP9, Putative hydrolase RBBP9, humanhuman

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RBBP9O75884 LRRC23-209ENST00000443597 1628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 KLC1-207ENST00000445352 2416 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 UCKL1-202ENST00000358711 1845 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 GPRIN2-201ENST00000374314 1696 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AL163051.1-201ENST00000569214 1512 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SHTN1-203ENST00000392901 2190 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 LINC00595-204ENST00000434974 2692 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SLC27A2-201ENST00000267842 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MAEA-202ENST00000303400 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ANKRD54-204ENST00000411961 946 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CKBP1-201ENST00000565489 1086 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC026271.3-201ENST00000571884 352 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ARMC4P1-202ENST00000576034 643 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SQSTM1-216ENST00000626660 274 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CGB7-202ENST00000596965 1949 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PDIA5-201ENST00000316218 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 NAT6-201ENST00000354862 1330 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 JHDM1D-AS1-201ENST00000566699 2380 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CXXC1P1-201ENST00000483225 1897 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ROPN1-209ENST00000495093 1376 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RUNX2-204ENST00000371438 5698 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MRPL3-201ENST00000264995 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RHNO1-209ENST00000618250 2070 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SUFU-202ENST00000369902 5001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PCDHA12-201ENST00000398631 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PURB-201ENST00000395699 9069 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ARSI-201ENST00000328668 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AHDC1-202ENST00000374011 6438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 LZTS1-203ENST00000522290 1614 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PML-206ENST00000395135 2199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ATP5D-201ENST00000215375 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 HLA-DRB1-201ENST00000360004 1229 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PDCD2-202ENST00000392090 936 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RALGPS1-206ENST00000394011 819 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 HOXA9-202ENST00000396345 797 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 UBE2F-203ENST00000409633 837 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC004951.3-201ENST00000418645 1148 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ELP6-205ENST00000439305 880 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ZNF599-203ENST00000588760 948 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AL353593.2-202ENST00000602947 550 ntTSL 4 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC073195.1-201ENST00000607241 877 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC103746.1-201ENST00000617440 1133 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AL359736.2-201ENST00000621992 437 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FCMR-210ENST00000628511 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 HAUS4-217ENST00000555367 1454 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 EPB41L3-204ENST00000540638 3370 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SRSF12-201ENST00000452027 3599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RTKN2-203ENST00000395260 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ERCC2-205ENST00000485403 1538 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TSNARE1-204ENST00000519651 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 RTN1-201ENST00000267484 3435 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 PCDHA3-201ENST00000522353 5260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 FAM110A-201ENST00000246100 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 DOC2A-209ENST00000564979 1630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 THAP3-203ENST00000377627 2053 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 POU4F2-201ENST00000281321 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 AC004835.1-201ENST00000428222 2907 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 CTAG2-201ENST00000247306 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 MCAT-202ENST00000327555 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 SIVA1-201ENST00000329967 802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
RBBP9O75884 DMRT2-206ENST00000412350 1244 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.9 ms