Protein–RNA interactions for Protein: O75683

SURF6, Surfeit locus protein 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SURF6O75683 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AL117335.1-203ENST00000619200 948 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF6O75683 ASCC2-202ENST00000397771 2823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF6O75683 NADK2-206ENST00000506945 1437 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF6O75683 RALGPS1-208ENST00000424082 2362 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF6O75683 NOMO2-212ENST00000622306 4252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF6O75683 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
SURF6O75683 FHL1-205ENST00000370690 2441 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 KIF21B-203ENST00000422435 5519 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 ZDHHC2-201ENST00000262096 6377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 ARNTL-203ENST00000403290 2746 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 ARSA-204ENST00000395621 1918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 ARHGEF28-204ENST00000437974 5792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 S100A11-201ENST00000271638 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 CCS-201ENST00000310190 942 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 DDX43P3-201ENST00000441064 443 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 NUS1P1-201ENST00000446295 882 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC096582.2-201ENST00000510860 516 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 BARHL1-202ENST00000542090 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 AC079385.1-201ENST00000551505 570 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 GINS4-206ENST00000520710 2022 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 HS3ST2-201ENST00000261374 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
SURF6O75683 PGLYRP2-202ENST00000340880 2230 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
SURF6O75683 PRR36-202ENST00000618550 4456 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
SURF6O75683 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 SHANK3-203ENST00000445220 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 SRPX-202ENST00000432886 1725 ntTSL 2 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 IRF3-202ENST00000377135 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 TRIM15-207ENST00000376694 2214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 MIEF2-202ENST00000395703 718 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 TNFSF13-204ENST00000396542 726 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 PRR29-207ENST00000580752 458 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 CCNC-219ENST00000627680 896 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 ETFBKMT-202ENST00000395763 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 EEPD1-201ENST00000242108 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 RFXANK-205ENST00000456252 1325 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
SURF6O75683 LRRC25-201ENST00000339007 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AC074389.1-201ENST00000382528 1423 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AKT1S1-207ENST00000391835 3075 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 HMGA1-205ENST00000447654 2159 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 LYRM9-203ENST00000460380 2196 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 FAM222A-201ENST00000358906 2731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 DBNDD2-202ENST00000360981 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 HYI-201ENST00000372425 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AL645608.6-201ENST00000418300 402 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AC139749.1-201ENST00000534584 1094 ntTSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 ADA-207ENST00000537820 1128 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 PRELID1P1-202ENST00000567272 903 ntBASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 GPR135-201ENST00000395116 4578 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 INO80E-201ENST00000304516 1489 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 ECHDC1-214ENST00000474289 2443 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 MCCC1-214ENST00000610757 2410 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 LUC7L-202ENST00000337351 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 LUC7L-204ENST00000397783 1504 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
SURF6O75683 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 ZNF416-201ENST00000196489 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 SLC25A43-201ENST00000217909 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 ENTPD6-202ENST00000360031 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 TRIM8-201ENST00000302424 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 SLC22A23-203ENST00000406686 5658 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 ANKRD6-201ENST00000339746 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 C2CD2L-201ENST00000336702 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 COX5BP2-201ENST00000392354 334 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 POM121L3P-201ENST00000419331 1163 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 EIF5A2-203ENST00000474096 570 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 MYL6-203ENST00000536128 1221 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AC012645.3-201ENST00000568506 470 ntTSL 3 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 SPAG7-207ENST00000575142 1094 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AC011467.2-201ENST00000598425 242 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 FDXR-203ENST00000420580 1705 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AL445238.1-203ENST00000606050 1525 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 SCRIB-201ENST00000320476 5143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
SURF6O75683 AC133561.2-201ENST00000380145 1802 ntTSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms