Protein–RNA interactions for Protein: O14936

CASK, Peripheral plasma membrane protein CASK, humanhuman

Predictions only

Length 926 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASKO14936 CATIP-AS1-202ENST00000441749 480 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 REPIN1-217ENST00000518514 478 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 LINC00599-204ENST00000521242 716 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 GRP-204ENST00000529320 824 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 NEK7-207ENST00000538004 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 GPX4-210ENST00000611653 793 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 TM2D2-201ENST00000397070 1631 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 SUPT20H-202ENST00000356185 2681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 TADA3-202ENST00000343450 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 SULT1A1-204ENST00000395609 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 ACSF3-202ENST00000378345 1541 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 ARFRP1-213ENST00000619493 2456 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 TPD52L1-202ENST00000368388 2147 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 HOTTIP-202ENST00000472494 2285 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 PML-220ENST00000569477 2251 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
CASKO14936 IRF7-202ENST00000348655 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 ABCC5-204ENST00000392579 1848 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 DBN1-201ENST00000292385 3072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 PLIN2-201ENST00000276914 1972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 RNF112-201ENST00000461366 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 DMPK-201ENST00000291270 2787 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 ZDHHC20-202ENST00000382466 5338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 ZHX3-212ENST00000558993 1528 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 CACNA1A-238ENST00000637276 7135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 LHX3-203ENST00000619587 2698 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 INSL3-202ENST00000379695 899 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 GRAMD4P1-201ENST00000435181 1110 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC051649.1-201ENST00000509204 330 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 DRAP1-205ENST00000527119 581 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 BCL2L12-208ENST00000600947 633 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 CALHM3-201ENST00000369783 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 RGS12-203ENST00000344733 5469 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 NFATC4-208ENST00000553708 5367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 RABGAP1L-204ENST00000357444 2605 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 PHKG2-202ENST00000424889 1566 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 CA7-202ENST00000394069 1713 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 PRCC-201ENST00000271526 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 INO80E-207ENST00000563197 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 ACSS2-201ENST00000253382 2925 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 MPP2-206ENST00000518766 1896 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 DISP3-202ENST00000304391 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 OGFOD2-205ENST00000454694 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
CASKO14936 TBC1D3P2-202ENST00000577902 1649 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 SNAPC4-201ENST00000298532 5010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 TTLL9-205ENST00000375938 2623 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 CYP4F2-201ENST00000011989 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC093901.1-201ENST00000414886 778 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 HSD11B1L-205ENST00000422535 730 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 AC005091.1-201ENST00000441955 1190 ntTSL 3 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 IAH1-202ENST00000470914 2137 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 AP003396.1-201ENST00000501918 507 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 C5orf49-202ENST00000509627 1020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 LY6E-209ENST00000521003 740 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 ANKRD34C-AS1-203ENST00000559225 528 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 CHRNB1-207ENST00000575379 1095 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 LINC00910-203ENST00000587874 544 ntTSL 4 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 YPEL3-202ENST00000398841 1588 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 WIPI1-202ENST00000546360 1575 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 UBE2E3-209ENST00000602710 1556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 AZU1-202ENST00000592205 1713 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 ARFGAP2-229ENST00000627920 2613 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 CD164L2-202ENST00000374027 1457 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 RASSF7-205ENST00000454668 1450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 CASKIN2-205ENST00000581870 1612 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 NDN-201ENST00000331837 1931 ntAPPRIS P1 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 PILRB-208ENST00000452089 2099 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 ZBTB45-202ENST00000594051 2541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
CASKO14936 VPS51-201ENST00000279281 2714 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 RGS20-203ENST00000344277 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 ZNF589-203ENST00000427617 1677 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 NFYC-AS1-201ENST00000606277 1687 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 TAX1BP3-201ENST00000225525 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 JAKMIP1-208ENST00000637373 1362 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
CASKO14936 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.7 ms