Protein–RNA interactions for Protein: A8MQ27

NEURL1B, E3 ubiquitin-protein ligase NEURL1B, humanhuman

Predictions only

Length 555 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEURL1BA8MQ27 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 NKIRAS2-207ENST00000449471 1461 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 BAIAP2L2-202ENST00000381669 2146 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 GNA12-201ENST00000275364 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 KBTBD2-201ENST00000304056 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 ADORA2A-214ENST00000611543 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 ASIC3-201ENST00000297512 1718 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 ANAPC11-211ENST00000575195 1361 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 DOK7-201ENST00000340083 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 DOK7-203ENST00000507039 2551 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 LZTS2-202ENST00000370223 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 TRIP6-201ENST00000200457 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
NEURL1BA8MQ27 TSKS-201ENST00000246801 1883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ESR1-204ENST00000406599 1251 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AL391650.1-205ENST00000433939 579 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 STK25P1-201ENST00000585406 838 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FOXP1-223ENST00000622151 429 ntTSL 3 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AIRN-201ENST00000601203 4374 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RAI2-201ENST00000331511 2317 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 USP18-201ENST00000215794 2129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 BPGM-203ENST00000418040 1870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC026362.1-201ENST00000540866 5618 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LAMTOR5-201ENST00000256644 868 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LAMTOR5-204ENST00000483260 694 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 IGHV3-22-201ENST00000520721 359 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CYB561-217ENST00000582997 877 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC011530.1-201ENST00000593999 558 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LAMTOR5-206ENST00000602318 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TM2D1-212ENST00000606498 969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 NPAS4-204ENST00000639555 878 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 UMOD-202ENST00000396134 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PSRC1-203ENST00000369907 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PSRC1-206ENST00000409267 1730 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LRRC27-214ENST00000625755 1738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC105411.1-202ENST00000565050 1476 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RIN1-205ENST00000530056 2122 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TRIM60-203ENST00000508504 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 UBE2K-201ENST00000261427 5245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TCP11-201ENST00000244645 2018 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ZBTB7A-201ENST00000322357 5422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LPAR3-201ENST00000370611 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 REXO1L11P-201ENST00000620964 1927 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FAM13C-204ENST00000468840 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 GLS-202ENST00000338435 4475 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 FERMT2-204ENST00000399304 2082 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 SIGLEC8-202ENST00000340550 1293 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 KLF4P1-201ENST00000412782 1185 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AC005104.2-201ENST00000427818 678 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 C1QB-203ENST00000509305 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AL157871.1-202ENST00000556458 478 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 TBKBP1-204ENST00000622396 2010 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PPFIA1-202ENST00000389547 4133 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 SEC22C-202ENST00000273156 1608 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 HLA-J-201ENST00000462773 1622 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AZIN2-203ENST00000373441 1443 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RAB17-201ENST00000264601 1966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 KIZ-211ENST00000619574 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 DYNC1LI2-201ENST00000258198 4515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 NOP56-201ENST00000329276 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 AL138828.1-202ENST00000576956 1881 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 RASA4B-201ENST00000306682 2589 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 GPANK1-202ENST00000375895 1800 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 BTG3-202ENST00000348354 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
NEURL1BA8MQ27 NSDHL-203ENST00000440023 1630 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.7 ms