Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ACTG1-201ENST00000331925 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AL445686.2-201ENST00000577528 1445 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 KCNMA1-201ENST00000286627 6194 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 JMJD6-202ENST00000397625 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 IGSF8-202ENST00000368086 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 FBXO21-208ENST00000622495 6040 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 A4GALT-202ENST00000381278 1935 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC011446.2-202ENST00000592882 756 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CR769767.2-201ENST00000622735 460 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RAD1-202ENST00000341754 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 UVSSA-209ENST00000512728 1668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SLC10A3-203ENST00000393586 1893 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SLC35A2-217ENST00000635589 1424 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ADRA1A-204ENST00000380573 2548 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PAPD5-203ENST00000561678 2916 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AQP10-203ENST00000484864 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZNF256-202ENST00000598928 1958 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 KCNC1-202ENST00000379472 7965 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 LUC7L-201ENST00000293872 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MRPL54-201ENST00000330133 626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CHPF-202ENST00000373891 1079 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AVP-201ENST00000380293 619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 OOEP-AS1-201ENST00000445350 463 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MVB12A-204ENST00000528515 686 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 IRX5-204ENST00000560154 879 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ATP5D-207ENST00000591660 637 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 JRK-210ENST00000614134 8932 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AL023803.3-201ENST00000615559 522 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 IRX5-205ENST00000620085 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC113410.3-201ENST00000623366 203 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CNTNAP3-205ENST00000377659 2649 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZNF211-201ENST00000240731 2440 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PRRT2-216ENST00000637403 2033 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 GXYLT2-201ENST00000389617 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RGMB-AS1-201ENST00000498871 1903 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 RAB39A-201ENST00000320578 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZMYM3-203ENST00000373981 1841 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SNX1-208ENST00000559844 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 TNIP1-220ENST00000610535 2726 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ALDH16A1-201ENST00000293350 3153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MAPK8IP1-202ENST00000395629 3180 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SEMA3B-204ENST00000433753 2755 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MSI2-201ENST00000284073 6364 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 GLUD1-201ENST00000277865 3039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 C5orf30-201ENST00000319933 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CXorf67-201ENST00000342995 1929 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SSX2IP-210ENST00000605755 1933 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 OR4D1-202ENST00000641449 4925 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 EMC6-201ENST00000248378 653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 NDUFS6-201ENST00000274137 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 LYPD1-201ENST00000345008 1033 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 UBB-203ENST00000395839 1012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 KIRREL3-AS3-201ENST00000404882 831 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AL445685.1-201ENST00000425802 762 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC012618.3-203ENST00000426044 917 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MRPL2-207ENST00000487429 905 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AC100839.1-201ENST00000559589 577 ntTSL 4 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 WWOX-216ENST00000569818 525 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 GOLGA2P10-205ENST00000618267 983 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AGO3-202ENST00000324350 1726 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 CAMK4-210ENST00000512453 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 HOXA-AS3-205ENST00000524304 2063 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 MOAP1-202ENST00000556883 2529 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 SLC22A3-201ENST00000275300 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AGER-205ENST00000375069 1538 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 AGAP2-AS1-201ENST00000542466 1500 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
CCDC182A6NF36 GAS7-210ENST00000579158 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms