Protein–RNA interactions for Protein: A0A0J9YYF1

TRBV7-4, T-cell receptor beta variable 7-4 (gene/pseudogene) (Fragment), humanhuman

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Length 115 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TIMP4-201ENST00000287814 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 FAM131A-204ENST00000418281 1664 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ARF1-214ENST00000541182 2006 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 DPP6-203ENST00000404039 4798 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 AC008393.1-201ENST00000499601 1454 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NFIX-205ENST00000585575 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMIZ1-201ENST00000334512 7546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 METTL26-203ENST00000397664 604 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 A3GALT2-201ENST00000442999 1023 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 MIXL1-202ENST00000542034 839 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 FXN-201ENST00000377270 2608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CAV3-201ENST00000343849 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 SPI1-202ENST00000378538 1403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 TRIM7-204ENST00000393319 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CARD10-201ENST00000251973 3934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 RAB28-201ENST00000288723 1810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 CD99-210ENST00000611428 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 EWSR1-203ENST00000332050 2552 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
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TRBV7-4A0A0J9YYF1 ECE2-201ENST00000324557 1823 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 CYP2D7-201ENST00000358097 1655 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 RWDD4-206ENST00000512740 1393 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 NOVA2-201ENST00000263257 7803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ZMYND11-214ENST00000509513 2065 ntTSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 ADD1-205ENST00000398125 4079 ntTSL 5 BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.88□□□□□ -0.67
TRBV7-4A0A0J9YYF1 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC10.88□□□□□ -0.67
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