Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6V7

DDX49, Probable ATP-dependent RNA helicase DDX49, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DDX49Q9Y6V7 AC068134.2-201ENST00000437095 576 ntTSL 3 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 ELOC-207ENST00000522337 816 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 LINC01896-206ENST00000575722 1256 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 TSEN34-204ENST00000429671 1912 ntTSL 2 BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 ALG2-203ENST00000476832 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 LDLRAD4-218ENST00000592991 1640 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC29.16■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 ITPKA-201ENST00000260386 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 INPP4A-203ENST00000409463 1565 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 PDF-201ENST00000288022 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 GDF1-201ENST00000247005 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 CERS1-204ENST00000623882 2517 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 C16orf74-204ENST00000602719 1002 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 AC145676.1-201ENST00000514988 2004 ntBASIC29.14■■■□□ 2.26
DDX49Q9Y6V7 GCLC-209ENST00000514004 2356 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 AC018755.3-201ENST00000598755 664 ntTSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 C16orf95-206ENST00000618367 974 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 DHFR-203ENST00000505337 1719 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 MAP3K8-203ENST00000375322 932 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 CHST11-203ENST00000547956 936 ntTSL 2 BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 RNF126P1-201ENST00000567452 1320 ntBASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 PPM1B-202ENST00000345249 1713 ntTSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 ATOH7-201ENST00000373673 1480 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 HOMER3-202ENST00000392351 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 EID2-201ENST00000390658 1629 ntAPPRIS P1 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 MKRN1-202ENST00000443720 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 SP5-201ENST00000375281 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 RPRML-201ENST00000322329 1093 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 GADD45A-205ENST00000617962 1142 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 GATS-205ENST00000436886 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 NKX2-1-204ENST00000522719 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 COPZ2-210ENST00000621465 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 DCDC2C-201ENST00000399143 1476 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC29.08■■■□□ 2.25
DDX49Q9Y6V7 SLC35D2-201ENST00000253270 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 SSTR4-201ENST00000255008 1427 ntAPPRIS P1 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC29.07■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 AC078883.1-202ENST00000450443 1397 ntTSL 3 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 PEX7-203ENST00000541292 945 ntTSL 5 BASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC29.06■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 MAZ-205ENST00000562337 1574 ntTSL 3 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC29.05■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 C8orf58-202ENST00000409586 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 AC027237.3-202ENST00000558617 1778 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 TTC39C-209ENST00000584250 1048 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 RAD21-AS1-201ENST00000521487 2010 ntTSL 1 (best) BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC29.04■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 PLEKHF2-202ENST00000519516 1144 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 TSPOAP1-AS1-205ENST00000580022 2337 ntTSL 2 BASIC29.03■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 HABP4-202ENST00000375251 2304 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 MDFIC-208ENST00000614186 1068 ntTSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.02■■■□□ 2.24
DDX49Q9Y6V7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX49Q9Y6V7 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX49Q9Y6V7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.01■■■□□ 2.23
DDX49Q9Y6V7 RPUSD1-208ENST00000567114 1835 ntTSL 2 BASIC29.01■■■□□ 2.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 10 ms