Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6Q9

NCOA3, Nuclear receptor coactivator 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NCOA3Q9Y6Q9 RDX-210ENST00000530301 1549 ntTSL 1 (best) BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.82■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 MT1E-201ENST00000306061 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 ARHGDIA-203ENST00000541078 1517 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 AC010913.1-201ENST00000608612 420 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 ZAR1-201ENST00000327939 1460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 HMCES-202ENST00000389735 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC34.79■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC34.78■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 MYDGF-201ENST00000262947 1018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 FKBP1A-205ENST00000439640 1583 ntTSL 3 BASIC34.77■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC34.76■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 LRMDA-215ENST00000611255 1040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.16
NCOA3Q9Y6Q9 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC34.75■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 HOXD8-201ENST00000313173 1917 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.75■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.73■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 RPL31-208ENST00000409733 825 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.72■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 CUL4A-209ENST00000488558 1111 ntTSL 3 BASIC34.71■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 TFEB-204ENST00000373033 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 FAM107A-203ENST00000447756 1432 ntTSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 LMNTD2-201ENST00000329451 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 SHOX2-204ENST00000483851 1866 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 C5orf38-202ENST00000397835 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 AC079305.3-201ENST00000455416 218 ntTSL 5 BASIC34.7■■■■□ 3.15
NCOA3Q9Y6Q9 PQLC3-204ENST00000441908 1784 ntTSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 SH3GL3-202ENST00000427482 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 TPRG1L-202ENST00000378344 2414 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 MRPS34-202ENST00000397375 1024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 SMUG1-203ENST00000401977 1082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 FEZF2-202ENST00000475839 1918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.69■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 FAM98C-202ENST00000343358 1006 ntTSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 SNAI3-AS1-203ENST00000565633 829 ntTSL 5 BASIC34.68■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 PHYH-201ENST00000263038 1577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 WTAP-207ENST00000631126 1430 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 NDEL1-219ENST00000585098 454 ntTSL 3 BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 KLHL35-204ENST00000539798 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 PHOX2A-201ENST00000298231 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 RNASET2-210ENST00000508775 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 CHTF8-205ENST00000519520 856 ntTSL 2 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 CDKN3-207ENST00000543789 610 ntTSL 5 BASIC34.66■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 ST7-205ENST00000393446 2114 ntTSL 5 BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 EIF4EBP1-201ENST00000338825 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 FAM173A-207ENST00000569529 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 ARHGEF7-AS2-201ENST00000425094 1239 ntTSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC34.64■■■■□ 3.14
NCOA3Q9Y6Q9 MPP6-203ENST00000409761 1703 ntTSL 5 BASIC34.63■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 E2F4-201ENST00000379378 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 FXYD7-204ENST00000588265 636 ntTSL 2 BASIC34.62■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 TMUB1-201ENST00000297533 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 PHF20L1-207ENST00000395379 1998 ntTSL 5 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 PCYT2-204ENST00000570388 1474 ntTSL 2 BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 SLC52A2-201ENST00000329994 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 HM13-AS1-201ENST00000412178 489 ntTSL 3 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 CCNYL1-203ENST00000392209 1952 ntTSL 2 BASIC34.6■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 WDR38-202ENST00000613760 1323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 PARL-202ENST00000317096 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 MYCL-202ENST00000372816 1688 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 ST7-202ENST00000323984 2142 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 ST7-207ENST00000393449 2127 ntTSL 5 BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 EMID1-201ENST00000334018 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 MAGI2-AS3-201ENST00000414797 1072 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 UNC93B8-201ENST00000511903 705 ntBASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 CASTOR2-201ENST00000616305 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 SEPT3-203ENST00000396426 2586 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC34.57■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 MIR4787-201ENST00000607364 84 ntBASIC34.57■■■■□ 3.13
NCOA3Q9Y6Q9 AL359504.2-201ENST00000605506 1601 ntBASIC34.57■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 AC008105.3-203ENST00000591365 2238 ntTSL 2 BASIC34.57■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 PRR5-ARHGAP8-202ENST00000361473 2013 ntTSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 PEMT-201ENST00000255389 1013 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 RPS2P7-201ENST00000447334 885 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC34.55■■■■□ 3.12
NCOA3Q9Y6Q9 AL139246.5-201ENST00000606645 996 ntBASIC34.55■■■■□ 3.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms