Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6N9

USH1C, Harmonin, humanhuman

Predictions only

Length 552 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USH1CQ9Y6N9 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 CTF1-202ENST00000395019 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 CHML-205ENST00000638160 705 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 LINC00273-201ENST00000539813 1452 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ADAT3-201ENST00000329478 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 FTCDNL1-201ENST00000416668 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 PSMG4-205ENST00000419065 629 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ST7-201ENST00000265437 2899 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 SPOCK3-221ENST00000512648 1456 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 FUS-202ENST00000380244 1818 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
USH1CQ9Y6N9 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 INAFM1-201ENST00000552360 1255 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 SSBP4-201ENST00000270061 1768 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 BIN1-203ENST00000346226 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 TMEM150C-201ENST00000449862 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 GNB1-210ENST00000615252 3048 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 FOXO1-201ENST00000379561 5735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 TSPAN10-203ENST00000574882 1837 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 GTF2E2-201ENST00000355904 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 AZIN2-201ENST00000294517 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 R3HCC1-201ENST00000265806 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 AC005559.1-201ENST00000589661 871 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
USH1CQ9Y6N9 AC092755.2-201ENST00000560199 402 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC24.14■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 TMEM44-202ENST00000347147 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.13■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 NAA50-207ENST00000493900 962 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 MAGI2-201ENST00000354212 6880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
USH1CQ9Y6N9 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.3 ms