Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5K3

PCYT1B, Choline-phosphate cytidylyltransferase B, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 369 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCYT1BQ9Y5K3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 CPTP-201ENST00000343938 2190 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 VEGFA-209ENST00000425836 1575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 AP003068.2-202ENST00000526623 1662 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
PCYT1BQ9Y5K3 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.2■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 CDKN3-202ENST00000335183 893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 CDKN3-211ENST00000611205 874 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 CARM1-202ENST00000344150 2722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 TANGO2-214ENST00000447208 2086 ntTSL 3 BASIC24.19■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 NDEL1-202ENST00000380025 2181 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 HDGFL1-201ENST00000510882 2174 ntAPPRIS P1 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 PIK3R2-207ENST00000617130 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 AC093536.1-201ENST00000569153 554 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 LAT-201ENST00000354453 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 RSPH1-201ENST00000291536 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 C1QTNF5-202ENST00000528368 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 HOXC9-201ENST00000303450 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 RHBDD2-202ENST00000318622 1878 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 CLK2-203ENST00000368361 2166 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 TM6SF1-204ENST00000379390 1638 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 NRARP-201ENST00000356628 1770 ntAPPRIS P1 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 MSRB1-206ENST00000622125 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 BARX1-202ENST00000401724 1323 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
PCYT1BQ9Y5K3 RUNX1-205ENST00000399240 1590 ntTSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 RAB3IL1-202ENST00000394836 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 ANGPTL6-203ENST00000589181 1579 ntTSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 IHH-201ENST00000295731 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 TTC3-225ENST00000540756 2025 ntTSL 2 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 ZSCAN18-202ENST00000421612 1488 ntTSL 4 BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 CAPNS1-204ENST00000587718 1558 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 SCN1B-201ENST00000262631 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 TNIP2-201ENST00000315423 1974 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 RCC1L-201ENST00000610322 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 AC142472.1-201ENST00000612013 1741 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 EPHB2-207ENST00000544305 1709 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
PCYT1BQ9Y5K3 IGFBP7-201ENST00000295666 1427 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 AC008105.2-203ENST00000591361 550 ntTSL 4 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.07■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 DNAJB2-202ENST00000392086 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 RNF19B-201ENST00000235150 2334 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
PCYT1BQ9Y5K3 AKT1S1-201ENST00000344175 1760 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.3 ms