Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y4K3

TRAF6, TNF receptor-associated factor 6, humanhuman

Predictions only

Length 522 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRAF6Q9Y4K3 C11orf95-204ENST00000546282 390 ntTSL 3 BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 SPATA33-209ENST00000579310 1490 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 GSC-201ENST00000238558 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 DACT1-206ENST00000556859 2239 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 PCYT2-203ENST00000538936 5147 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 DLG3-203ENST00000374360 5905 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 SLC35D2-202ENST00000375257 889 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 AC116407.1-201ENST00000398832 1599 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 BIN1-210ENST00000393041 2272 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 G6PC3-201ENST00000269097 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.79■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 MAP3K3-210ENST00000584573 2480 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R35-201ENST00000292330 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 CHML-204ENST00000638121 920 ntTSL 2 BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 KHSRP-201ENST00000398148 2993 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 CEBPA-AS1-201ENST00000592982 2198 ntBASIC23.78■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 FKBP1A-210ENST00000614856 562 ntTSL 2 BASIC23.77■■□□□ 1.4
TRAF6Q9Y4K3 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 IGFBPL1-201ENST00000377694 1093 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.76■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 RINL-202ENST00000591812 1910 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 PINK1-201ENST00000321556 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 TSPAN4-207ENST00000397411 1025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 HGH1-207ENST00000628266 258 ntTSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 RHOC-202ENST00000339083 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 SNAI3-AS1-204ENST00000567997 2048 ntBASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 LINC01971-201ENST00000617888 1048 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 AL451007.3-201ENST00000640271 588 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 PIP5K1C-203ENST00000539785 2289 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
TRAF6Q9Y4K3 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 LSM14B-204ENST00000370915 1079 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 AC004540.2-201ENST00000451368 611 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L13-201ENST00000554103 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L15-201ENST00000611059 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L23-201ENST00000615195 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 NFKBIE-201ENST00000275015 2581 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
TRAF6Q9Y4K3 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 311.8 ms