Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3C4

TPRKB, EKC/KEOPS complex subunit TPRKB, humanhuman

Predictions only

Length 175 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TPRKBQ9Y3C4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 SLC35A2-207ENST00000445167 1739 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 STOML1-202ENST00000316911 1891 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AL109917.1-201ENST00000412228 906 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 MARCKSL1-201ENST00000329421 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 ELOA-201ENST00000418390 5154 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 LINC01089-207ENST00000538335 630 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 AP000547.3-202ENST00000592107 1019 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
TPRKBQ9Y3C4 TMEM150A-202ENST00000334462 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 FEZ1-201ENST00000278919 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 MBD2-202ENST00000398398 1237 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 MBD2-205ENST00000583046 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 WHAMMP2-203ENST00000563942 1603 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 IL13RA1-201ENST00000371642 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 NMB-202ENST00000394588 1017 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 MNX1-207ENST00000543409 1620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 RCC1L-205ENST00000618035 1409 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 MYBL1-204ENST00000522677 5192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 AGAP3-201ENST00000335367 2675 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
TPRKBQ9Y3C4 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 TARSL2-207ENST00000615656 2356 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 EBPL-202ENST00000378268 680 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 JMJD8-202ENST00000562111 823 ntTSL 2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 AC009133.5-201ENST00000562594 473 ntTSL 4 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 EXOSC6-201ENST00000435634 5153 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 FZD8-201ENST00000374694 4030 ntAPPRIS P1 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 DYRK3-203ENST00000367109 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 HADH-203ENST00000505878 1719 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 GTF3C4-202ENST00000483873 1417 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 KLC2-205ENST00000394078 1557 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 MAF-203ENST00000569649 1217 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 BMP6-201ENST00000283147 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 GIT1-210ENST00000579937 2798 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 CCDC151-202ENST00000586836 1867 ntTSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 CFAP73-201ENST00000335621 1514 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
TPRKBQ9Y3C4 SLBP-206ENST00000489418 1977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.3 ms