Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y3B4

SF3B6, Splicing factor 3B subunit 6, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 125 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SF3B6Q9Y3B4 AC009097.4-201ENST00000566738 777 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 UBE2S-203ENST00000589978 496 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 CASP9-202ENST00000348549 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 NRG2-203ENST00000340391 1944 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 GKAP1-202ENST00000376365 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 COX4I1-203ENST00000562336 873 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 U2AF1-204ENST00000459639 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 U2AF1L5-204ENST00000623375 1675 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC21.7■■□□□ 1.07
SF3B6Q9Y3B4 KLF15-201ENST00000296233 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 ST7L-206ENST00000369666 1815 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 ADGRB2-204ENST00000398542 5176 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 AP2M1-202ENST00000382456 2091 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 TSEN34-203ENST00000396388 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 PSMG4-202ENST00000380305 489 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 TERF2-207ENST00000567296 1129 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 RCE1-201ENST00000309657 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 SYT7-203ENST00000539008 2061 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 TBL2-222ENST00000610724 2165 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 SMOX-202ENST00000305958 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 AL139125.2-201ENST00000623134 1869 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 CMC4-202ENST00000369484 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 ARL2-SNX15-201ENST00000301886 2392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 ANKRD54-201ENST00000215941 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 EI24-212ENST00000615917 1407 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC21.66■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 R3HDM4-203ENST00000587975 1765 ntTSL 3 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 ERGIC1-202ENST00000393784 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
SF3B6Q9Y3B4 FJX1-201ENST00000317811 2450 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 TMEM202-AS1-202ENST00000565181 2325 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 LMTK3-202ENST00000600059 5113 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 SLC30A3-201ENST00000233535 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 ECHDC3-201ENST00000379215 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 MAD2L2-205ENST00000376669 864 ntTSL 3 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 NPHP3-202ENST00000383282 782 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 SMIM12-205ENST00000456842 918 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 RAB11FIP1-203ENST00000522727 1866 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 KCNQ3-202ENST00000519445 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 C21orf2-202ENST00000339818 2233 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 RABGGTA-202ENST00000399409 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 SRSF9-201ENST00000229390 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 COPRS-202ENST00000378634 1041 ntTSL 2 BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 AC108673.1-201ENST00000510422 1159 ntBASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 GSR-205ENST00000541648 1410 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 PTPN2-202ENST00000327283 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
SF3B6Q9Y3B4 ZBTB10-204ENST00000455036 5458 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.58■■□□□ 1.04
SF3B6Q9Y3B4 IGFBP3-201ENST00000275521 2262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.6 ms