Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y375

NDUFAF1, Complex I intermediate-associated protein 30, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 327 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NDUFAF1Q9Y375 RPUSD1-201ENST00000007264 2050 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 H2AFV-204ENST00000350771 687 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 PURG-202ENST00000475541 2875 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 LMTK3-201ENST00000270238 4972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 CDKN2A-201ENST00000304494 1218 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 MAD2L2-207ENST00000376692 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 AC113189.4-201ENST00000575331 5553 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-226ENST00000611736 1239 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 TSGA13-204ENST00000456951 2046 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 U2AF1L5-201ENST00000610664 897 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
NDUFAF1Q9Y375 DNLZ-201ENST00000371738 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 DVL1-201ENST00000378888 3239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 ZDHHC16-201ENST00000345745 1519 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 AP006261.1-201ENST00000584783 668 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 SLC35D2-203ENST00000375259 1361 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 U2AF1-203ENST00000398137 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 U2AF1L5-212ENST00000639996 1019 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 KAZN-207ENST00000503743 1475 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
NDUFAF1Q9Y375 RILPL1-205ENST00000636882 2258 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC23.32■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 ATP6V0A2-209ENST00000613625 1620 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 NDEL1-201ENST00000334527 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 NMB-201ENST00000360476 1007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 VEGFA-207ENST00000413642 1197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
NDUFAF1Q9Y375 ARHGEF35-201ENST00000378115 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 SHISA5-201ENST00000296444 2369 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 RAP2A-201ENST00000245304 5487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 PRR35-201ENST00000409413 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 LHX3-201ENST00000371746 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 BTBD2-201ENST00000255608 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
NDUFAF1Q9Y375 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 86.3 ms