Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2T2

AP3M1, AP-3 complex subunit mu-1, humanhuman

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AP3M1Q9Y2T2 FBXL6-201ENST00000331890 1785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 RPS2-210ENST00000530225 765 ntTSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 PKM-204ENST00000449901 2526 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 S100A10-202ENST00000368811 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 TMEM147-202ENST00000392204 935 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 AC142381.3-201ENST00000568208 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 TGFBRAP1-202ENST00000393359 5979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 FAM118A-205ENST00000441876 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 MAZ-203ENST00000545521 2333 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 TSPAN3-203ENST00000424443 1530 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 HAS2-AS1-201ENST00000514180 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 PRSS41-201ENST00000399677 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 SLC25A10-202ENST00000350690 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 ZFP90-204ENST00000564323 560 ntTSL 4 BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 ZFP90-219ENST00000611381 695 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 MBD3-202ENST00000434436 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 CACNA1H-201ENST00000348261 8208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
AP3M1Q9Y2T2 USP25-203ENST00000351097 2158 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 C1QTNF1-206ENST00000579760 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 PREB-201ENST00000260643 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 ZNF747-203ENST00000568028 1511 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 ANKRD9-205ENST00000560748 1413 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 PICALM-202ENST00000393346 2340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 AP000251.1-201ENST00000433071 822 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 AC087741.3-201ENST00000624270 1347 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 C8orf58-201ENST00000289989 2016 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 TMEM185A-208ENST00000611119 2662 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 NECAB2-201ENST00000305202 1608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 PLEKHJ1-201ENST00000326631 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 TCAM1P-201ENST00000463377 452 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 AC044849.2-201ENST00000606596 710 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 PHF23-212ENST00000576955 1944 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 NHLRC4-201ENST00000424439 2097 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 D2HGDH-203ENST00000403782 2208 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 PDIA6-201ENST00000272227 2338 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 PYCR1-202ENST00000337943 1890 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 AC231981.1-201ENST00000450917 974 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 CAPN10-208ENST00000404753 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 FKBP8-213ENST00000608443 1849 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
AP3M1Q9Y2T2 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 HDAC11-206ENST00000405025 576 ntTSL 4 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 CGGBP1-206ENST00000482016 1147 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 TBL1X-201ENST00000217964 5871 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 TMEM55B-202ENST00000398020 1696 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 MBOAT7-205ENST00000431666 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 HINT2-201ENST00000259667 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 BOD1-201ENST00000285908 1286 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 BOD1-206ENST00000480951 814 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 EPM2A-208ENST00000618445 1694 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 AP000911.1-206ENST00000531938 711 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 CTU1-201ENST00000421832 2087 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
AP3M1Q9Y2T2 AC018413.1-201ENST00000581996 1200 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms