Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J8

PADI2, Protein-arginine deiminase type-2, humanhuman

Predictions only

Length 665 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PADI2Q9Y2J8 MIR1-1HG-202ENST00000624914 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
PADI2Q9Y2J8 AP002414.2-202ENST00000590929 1450 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 SAP25-204ENST00000622764 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 REST-210ENST00000638187 1334 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 TXNRD2-205ENST00000400525 1874 ntTSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 MRPL4-201ENST00000253099 1455 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 ARPC2-202ENST00000315717 1505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 FCGRT-217ENST00000599988 660 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 OPRD1-202ENST00000621425 1217 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 PKM-203ENST00000389093 2279 ntTSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 GNG10-201ENST00000374293 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 SYT12-205ENST00000527043 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 FAM78B-201ENST00000338353 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 SOWAHD-201ENST00000343905 1552 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 AC010907.1-201ENST00000441632 807 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 SNX5-219ENST00000606602 885 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 MOB2-207ENST00000614710 705 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 TBX1-201ENST00000329705 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 DDAH2-212ENST00000375789 1688 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 DDAH2-213ENST00000375792 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 ZDHHC3-203ENST00000342790 1336 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 MAGI2-211ENST00000535697 6146 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 LTC4S-205ENST00000486713 496 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 AL157400.5-201ENST00000507624 621 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
PADI2Q9Y2J8 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 AC005540.1-201ENST00000413911 919 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 U85056.1-201ENST00000616429 682 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.5■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 FSD1-201ENST00000221856 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 APLP1-201ENST00000221891 2495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 CD6-206ENST00000452451 1782 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 HTR6-201ENST00000289753 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 HIST2H3C-201ENST00000369158 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 HIST2H3A-201ENST00000403683 1656 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 C16orf52-207ENST00000569656 1257 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 FOXO6-202ENST00000641094 1476 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
PADI2Q9Y2J8 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 ZMYND19-201ENST00000298585 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 SOX1-201ENST00000330949 2842 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 AC018358.1-201ENST00000631079 1402 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 RPL27A-206ENST00000530022 878 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 SMPD5-203ENST00000639008 1464 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 TTC36-201ENST00000302783 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 ZNF692-201ENST00000306601 1931 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 C14orf80-205ENST00000392523 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 CDPF1-201ENST00000314567 1875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 FGF20-201ENST00000180166 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 NXPH4-201ENST00000349394 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
PADI2Q9Y2J8 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms