Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y2J2

EPB41L3, Band 4.1-like protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPB41L3Q9Y2J2 PPP1R14B-201ENST00000309318 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 EIF5A-202ENST00000336458 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 DTNB-201ENST00000288642 2464 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 DTNB-208ENST00000406818 2474 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 UBALD2-203ENST00000589240 660 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 DLX2-202ENST00000466293 1852 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 ZNF470-206ENST00000601902 1640 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 MIR6090-201ENST00000622481 60 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 SLCO3A1-201ENST00000318445 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 AGBL5-201ENST00000323064 2382 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 BCAP31-201ENST00000345046 1589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 HNRNPLP2-201ENST00000568980 1570 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 POU2F2-215ENST00000560398 1788 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 CDC16-211ENST00000628084 2058 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 C19orf47-202ENST00000392035 2126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 P3H3-201ENST00000290510 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 MYPOP-201ENST00000322217 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 UBE2J2-202ENST00000349431 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 FEZ2-204ENST00000405912 1931 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 PCYT2-202ENST00000538721 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 LSR-204ENST00000361790 2210 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 DCUN1D5-201ENST00000260247 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 LMO1-202ENST00000428101 1038 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 FAM43A-201ENST00000329759 2494 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 EMID1-202ENST00000404755 2049 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
EPB41L3Q9Y2J2 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 CNNM2-201ENST00000369875 2059 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 DTNB-211ENST00000407661 2420 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 MARCH2-202ENST00000381035 1192 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 ECI1-203ENST00000562238 948 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 OVOL2-201ENST00000278780 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 TCEA2-202ENST00000343484 1235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 SUZ12P1-203ENST00000578195 985 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 DUSP8P4-201ENST00000399538 1761 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 RNF175-201ENST00000347063 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 CTBP2-211ENST00000494626 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 RABL6-202ENST00000357466 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 FZD9-201ENST00000344575 2338 ntAPPRIS P1 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 ANKRD16-201ENST00000191063 1567 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 SNF8-202ENST00000502492 2319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 FRMD8-203ENST00000416776 1818 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 DOCK5-202ENST00000410074 786 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 AC004837.3-201ENST00000420748 565 ntTSL 4 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 ARTN-204ENST00000438616 889 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 HOPX-206ENST00000503639 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 AC092803.2-201ENST00000564287 1899 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 FAM107B-211ENST00000468747 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 NAB1-202ENST00000409581 2360 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
EPB41L3Q9Y2J2 MAZ-208ENST00000563402 1461 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 MAZ-210ENST00000566906 1455 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 AP004609.3-201ENST00000610705 1884 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 RPL13-202ENST00000393099 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 SSBP3-202ENST00000357475 1533 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 LINC02323-201ENST00000559946 1603 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 NKIRAS2-202ENST00000316082 833 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 CALM3-209ENST00000597743 577 ntTSL 4 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 FAM124A-204ENST00000615498 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 NTN3-201ENST00000293973 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 GTPBP3-202ENST00000358792 1951 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 ANKS3-203ENST00000450067 2272 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 PGAM5-201ENST00000317555 1182 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 ATP5A1-220ENST00000593152 2258 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 FBXL8-201ENST00000258200 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 BRSK2-212ENST00000531197 3163 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 MFAP2-202ENST00000375535 1260 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 PRR5-202ENST00000336985 1878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 ALG1L9P-201ENST00000508969 2165 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 RNF166-201ENST00000312838 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 TMEM251-202ENST00000415050 1303 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 DUX4L28-201ENST00000623687 678 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 GPR25-201ENST00000304244 1224 ntAPPRIS P1 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 GSX2-202ENST00000503800 1181 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 LYNX1-208ENST00000615007 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 BICDL2-203ENST00000572449 1984 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
EPB41L3Q9Y2J2 AC012676.1-201ENST00000574705 1949 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 13.9 ms