Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y259

CHKB, Choline/ethanolamine kinase, humanhuman

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CHKBQ9Y259 BBC3-204ENST00000449228 1827 ntTSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 ETS1-201ENST00000319397 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 LSM7-201ENST00000252622 529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 TTBK2-207ENST00000567840 1961 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 CENPV-201ENST00000299736 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 LINC01918-201ENST00000436841 797 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 GRPEL2-204ENST00000513661 546 ntTSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 RPARP-AS1-205ENST00000596045 431 ntTSL 3 BASIC25.14■■□□□ 1.62
CHKBQ9Y259 MXRA7-202ENST00000375036 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.14■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 HSD17B12-202ENST00000395700 994 ntTSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 BANF1-208ENST00000533166 1135 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.13■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 KIF13A-207ENST00000502704 1330 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 CAPNS1-215ENST00000628018 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 TAF10-201ENST00000299424 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 BAX-202ENST00000345358 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 PRKAR1B-203ENST00000403562 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 WDR86-204ENST00000477459 1428 ntTSL 2 BASIC25.12■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 TSKU-201ENST00000333090 2712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 KCTD15-206ENST00000588881 1211 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 ARHGEF7-205ENST00000375739 5375 ntTSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 FAM66E-202ENST00000533615 2087 ntTSL 2 BASIC25.11■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 TPT1-202ENST00000379055 948 ntTSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 MED25-210ENST00000612854 801 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 MED25-213ENST00000620467 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 MED25-214ENST00000622402 642 ntTSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 MEN1-204ENST00000377313 1871 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 KCNG2-201ENST00000316249 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 HSF1-204ENST00000528838 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 AC091060.1-201ENST00000623524 1766 ntBASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 SRP68-213ENST00000629930 165 ntTSL 5 BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 YBX2-201ENST00000007699 1590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 R3HDM4-208ENST00000626716 138 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 PLEKHA8-201ENST00000258679 2293 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 FAM57A-202ENST00000308278 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
CHKBQ9Y259 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 TOP1MT-208ENST00000519148 1868 ntTSL 2 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 PKIG-207ENST00000372894 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 MDFIC-203ENST00000423503 474 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 HOXD-AS2-201ENST00000426965 927 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 RNF19B-202ENST00000356990 2598 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 HTRA1-201ENST00000368984 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 VSIG8-201ENST00000368100 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 EBF4-210ENST00000609451 2012 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 ZBTB25-202ENST00000555220 1440 ntTSL 1 (best) BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 RTN2-208ENST00000590526 2357 ntTSL 5 BASIC25.06■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 AL359258.2-201ENST00000564063 1566 ntBASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 AMIGO1-201ENST00000369862 2229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 BCL7B-202ENST00000411832 1458 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 KLHL21-203ENST00000463043 667 ntTSL 5 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 MAP4K3-211ENST00000484274 407 ntTSL 2 BASIC25.05■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 TIGD3-201ENST00000309880 2012 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 CLDND1-226ENST00000513287 999 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 ABHD12-202ENST00000376542 1725 ntTSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 C8orf58-206ENST00000614574 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 UNCX-201ENST00000316333 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
CHKBQ9Y259 ACSS1-202ENST00000376726 2244 ntTSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 MRPL51-201ENST00000229238 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC25.01■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 IZUMO4-202ENST00000395301 1021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 AC126177.7-201ENST00000547904 679 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 TBX2-AS1-202ENST00000589814 539 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 SOD3-201ENST00000382120 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 PPAN-202ENST00000393793 1575 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 CRTAP-202ENST00000449224 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 CDC16-204ENST00000360383 2211 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC25■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 CCDC136-206ENST00000464832 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 LDLRAD3-203ENST00000528989 1879 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 DNMT3A-206ENST00000406659 1775 ntTSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 CEP120-209ENST00000515110 606 ntTSL 3 BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 AC022413.1-201ENST00000624602 984 ntBASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
CHKBQ9Y259 GATA2-AS1-202ENST00000468377 1578 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.3 ms