Protein–RNA interactions for Protein: Q9UQE7

SMC3, Structural maintenance of chromosomes protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 1,217 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMC3Q9UQE7 DUX4L24-201ENST00000617576 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DUX4L22-201ENST00000618238 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DUX4L20-201ENST00000619712 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DUX4L21-201ENST00000622058 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DUX4L10-201ENST00000622460 1267 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DUX4L25-201ENST00000624915 1269 ntBASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 MORF4L1-202ENST00000379535 2274 ntTSL 2 BASIC28.74■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 CHST11-202ENST00000546689 756 ntTSL 2 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 KAT8-206ENST00000543774 1846 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 ADAMTSL5-202ENST00000395467 1533 ntTSL 5 BASIC28.73■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 WIPI2-204ENST00000404704 1663 ntTSL 5 BASIC28.72■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 VSTM2L-202ENST00000373461 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DHRS13-203ENST00000426464 1569 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 TMCO6-201ENST00000252100 1834 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 CIB2-202ENST00000539011 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 EBPL-201ENST00000242827 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 GNPTG-204ENST00000527137 386 ntTSL 2 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 DDN-AS1-203ENST00000552284 934 ntTSL 3 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 CAMK1D-203ENST00000615792 1725 ntTSL 5 BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 RRAD-202ENST00000420652 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.71■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 C2CD4D-201ENST00000454109 1757 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.19
SMC3Q9UQE7 RINL-208ENST00000598904 1846 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC28.7■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 C9orf50-201ENST00000372478 1620 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 TRAM2-AS1-201ENST00000453216 664 ntTSL 3 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 BIN1-211ENST00000409400 2143 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 PORCN-202ENST00000355961 1848 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 SLC25A23-203ENST00000334510 1424 ntTSL 1 (best) BASIC28.69■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 LAGE3-201ENST00000357360 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 PICALM-224ENST00000630913 2261 ntTSL 5 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 KDM4C-203ENST00000401787 1406 ntTSL 1 (best) BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 MAD2L2-201ENST00000235310 1860 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.68■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 LACTBL1-202ENST00000618559 1500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.67■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 CSNK1E-203ENST00000396832 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 C5orf66-AS1-201ENST00000507035 843 ntTSL 2 BASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 AC008813.1-201ENST00000536597 885 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 DUX4L11-201ENST00000611504 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 DUX4L12-201ENST00000614593 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 DUX4L14-201ENST00000621227 1267 ntBASIC28.66■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 EMC10-206ENST00000598585 1610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 ZDHHC16-206ENST00000370854 1798 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 CAAP1-205ENST00000520187 773 ntTSL 5 BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 EPB41L4B-202ENST00000374566 5800 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.65■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 CABP1-202ENST00000316803 1658 ntTSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 CRELD2-203ENST00000404488 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.18
SMC3Q9UQE7 YRDC-201ENST00000373044 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.64■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 MIR219A2-201ENST00000608502 1504 ntBASIC28.64■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 FBXL20-203ENST00000577399 1620 ntTSL 5 BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 ARHGDIG-201ENST00000219409 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 RANBP1-202ENST00000402752 1132 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 ATP8B2-201ENST00000368487 1523 ntTSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 KREMEN2-205ENST00000575769 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.63■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 ERN1-208ENST00000606895 2068 ntBASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 AC096888.1-201ENST00000487097 565 ntTSL 4 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 TSPAN13-201ENST00000262067 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.62■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 PARD6A-202ENST00000458121 1260 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 AMH-201ENST00000221496 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 CDK9-201ENST00000373264 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.61■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 AC148477.6-201ENST00000623746 465 ntBASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 PEX26-202ENST00000399744 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.6■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 ZNF821-201ENST00000313565 1874 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 MXD3-201ENST00000423571 1534 ntTSL 2 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 FSD1-204ENST00000597590 1634 ntTSL 5 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 LAPTM4B-203ENST00000521545 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 MPST-206ENST00000429360 1331 ntTSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 CEBPB-201ENST00000303004 1956 ntAPPRIS P1 BASIC28.59■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 SURF1-201ENST00000371974 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 SURF1-205ENST00000615505 991 ntTSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 AC010501.1-201ENST00000606270 1962 ntBASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 LSM6-202ENST00000502781 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.58■■■□□ 2.17
SMC3Q9UQE7 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 BHLHE23-201ENST00000370346 1057 ntAPPRIS P1 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 CCDC136-202ENST00000378685 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC28.57■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 CDC34-201ENST00000215574 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 CTXN1-201ENST00000318978 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 TYMP-203ENST00000395680 1608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 TYMP-204ENST00000395681 1604 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 HES6-205ENST00000409356 528 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 MLEC-202ENST00000412616 841 ntTSL 3 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC28.56■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 STARD10-220ENST00000545082 1085 ntTSL 3 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC28.55■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 SP8-202ENST00000418710 1618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
SMC3Q9UQE7 PIM3-201ENST00000360612 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.54■■■□□ 2.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.2 ms