Protein–RNA interactions for Protein: Q9UP65

PLA2G4C, Cytosolic phospholipase A2 gamma, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLA2G4CQ9UP65 MXRA7-203ENST00000449428 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4CQ9UP65 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4CQ9UP65 ARPC2-201ENST00000295685 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
PLA2G4CQ9UP65 FAH-213ENST00000561421 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 DEAF1-201ENST00000382409 2500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 MBD2-201ENST00000256429 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 RAD51-208ENST00000532743 1515 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 PROCA1-201ENST00000301039 1566 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 NEURL1B-203ENST00000522853 1263 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 RHEB-201ENST00000262187 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 CAMKK1-201ENST00000158166 2459 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 FOXG1-201ENST00000313071 4890 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 F8A1-201ENST00000610495 1713 ntAPPRIS P1 BASIC25.31■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 PCK2-202ENST00000396973 1830 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 FAM120AOS-202ENST00000423591 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 HNRNPUL1-221ENST00000617305 1018 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 CCND3-205ENST00000415497 1843 ntTSL 2 BASIC25.3■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 KANSL1L-207ENST00000452086 2334 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 FRAT2-201ENST00000371019 2213 ntAPPRIS P1 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 SLC9A3-AS1-207ENST00000607286 1357 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 PTGER1-201ENST00000292513 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 NELFB-202ENST00000634710 1887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 VIPR2-203ENST00000402066 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 SV2B-203ENST00000545111 2099 ntTSL 2 BASIC25.28■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 C11orf96-203ENST00000617612 1294 ntAPPRIS P1 BASIC25.27■■□□□ 1.64
PLA2G4CQ9UP65 RTN2-202ENST00000344680 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 FKBP1A-204ENST00000400137 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 POU3F3-201ENST00000361360 3064 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 FTCD-201ENST00000291670 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 AC025884.2-201ENST00000553429 711 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 SAE1-209ENST00000598840 1831 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 ZDHHC23-206ENST00000498275 2055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 PCSK6-216ENST00000615296 2921 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 TIMM29-201ENST00000270502 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 AC107214.1-201ENST00000457303 559 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 NKIRAS2-208ENST00000462043 585 ntTSL 4 BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 UBE2D2-205ENST00000505548 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 C12orf75-201ENST00000443585 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 WBP1-202ENST00000393972 1325 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 MDFIC-206ENST00000448022 484 ntTSL 2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 CDH23-208ENST00000461841 2000 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 CCDC61-204ENST00000595358 1817 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 LYPD6B-203ENST00000409642 1577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 NXPH3-201ENST00000328741 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 SLC16A3-214ENST00000582743 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 HOMER2-202ENST00000450735 1950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 OTUD5-202ENST00000376488 2692 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 PSMG1-201ENST00000331573 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 TYMP-201ENST00000252029 1630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 TSPY13P-201ENST00000338964 914 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.63
PLA2G4CQ9UP65 MRPL23-202ENST00000381519 643 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 MRPL23-205ENST00000397298 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 RP9P-202ENST00000450133 1212 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 EVC-203ENST00000509451 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 PKIG-205ENST00000372891 1443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 WHAMMP3-201ENST00000611636 1609 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 AC009831.1-201ENST00000580420 1582 ntBASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 SPIRE1-203ENST00000410092 5533 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 FBXL8-206ENST00000519917 1460 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 CLEC11A-201ENST00000250340 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 PQLC3-201ENST00000295083 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 AC004987.1-201ENST00000428627 508 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 ATP5G2P3-201ENST00000429083 425 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 PFN2-211ENST00000489155 636 ntTSL 4 BASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 MIR3960-201ENST00000583311 91 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC25.18■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 SLC25A6-201ENST00000381401 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 TMEM200C-201ENST00000383490 1920 ntAPPRIS P1 BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 METTL24-201ENST00000338882 1119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 POTEF-201ENST00000361163 1586 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 ENHO-201ENST00000399775 1082 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 PBX1-202ENST00000367897 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
PLA2G4CQ9UP65 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms